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基因组MicrosoftPowerPoint演示文稿.pptxVIP

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基因组MicrosoftPowerPoint演示文稿; 基因组(genome)是指细胞或生物体中一套完 整单倍体的遗传物质的总和。; 基因组学(Genomics),指对所有基因进行基因组作图(包括遗传图谱、物理图谱、转录图谱),核苷酸序列分析,基因定位和基因功能分析的一门科学。 基因组学包括两方面的内容:以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics)。;三、基因作图的概念 ;人类基因定位的基本方法 ;2、体细胞杂交定位;3、核酸杂交技术;(3)原位PCR;(5)功能克隆 ●通过纯化蛋白质的氨基酸序列信息分离鉴定未知基因; 病毒基因组 病毒基因组结构与功能的特点 1.不同病毒基因组大小相差较大 2.不同病毒基因组可以是不同结构的核酸 3.病毒基因组有连续的也有不连续的 4.病毒基因组的编码序列大于90% 5.单倍体基因组 6.基因有连续的和间断的 7.相关基因丛集 8.基因重叠;第11页/共40页;DNA; 原核生物基因组 原核生物基因组结构与功能的特点 1.基因组通常仅由环状双链DNA分子组成 2.基因组中只有一个复制起始点 3.具有操纵子结构 4.编码顺序一般不会重叠 5.基因是连续的,无内含子 6.编码区在基因组中所占比例(约占50%)远远大于真核基因组,但远远小于病毒基因组 7.基因组中重复序列很少 8.基因组中存在可移动DNA序列,包括插入序列和转座子 9. 基因组中GC含量变化很大,其范围从25%~75%;第14页/共40页;乳糖操纵子的结构;DNA;真核生物基因组的特点;真核生物基因组的特点;4.真核细胞基因转录产物为单顺反子mRNA,即一个结构基因转录生成一个mRNA分子,经翻译生成一条多肽链。;DNA;DNA;真核生物基因组的特点;真核生物基因组的特点;真核生物基因组的特点;DNA;人类基因组计划 (human genome project,HGP); 人类基因组计划是由美国科学家Renato Dulbecco于1986年首先提出的。1990年美国国会批准,人类基因组计划正式启动。其目标是在15年时间内至少投入30亿美元,完成人类全部基因组核苷酸序列分析。此后,德国,日本,英国,法国等国家的科学家也先后正式加入???计划。我国于1999年获准加入这项计划。;人类基因组计划的目的 ;人类基因组计划的意义; 人类基因组计划的4张图普; 先将染色体打成比较大的片段(几十-几百Kb), 利用分子标记将这些大片段排成重叠的克隆群(Contig), 分别测序后拼装. 这种策略叫基于克隆群(contig-based)的策略.;遗传图谱 遗传图谱(genetic map)又称连锁图谱(linkage map),是表示基因或DNA标志在染色体上以遗传距离表示的相对位置,反映染色体上两点之间的连锁关系。遗传距离通常以基因或DNA片段在染色体交换过程中分离的频率里摩(cM)来表示。;重组值=新组合/(亲本组合+新组合);物理图谱 物理图谱(physical map)指DNA序列上两点之间的实际距离。 基因或DNA标记之间的物理距离以核苷酸数目的多少来表示。物理图谱是进行DNA序列分析和基因组织结构研究的基础。;转录图谱 转录图谱(transcription map)又称cDNA(complementary DNA)计划或基因图谱。 在整个人类基因组中,只有不到5%的DNA序列为编码蛋白质的序列,因此,确定编码蛋白质的序列及其在基因组中的位置,才是真正的人类基因图谱。利用这份图谱,我们才能掌握人类基因的准确数目、每一个基因的序列及其在基因组中的位置,从而进一步的分析基因产物的功能及其与疾病的关系。;基因组序列分析 人类基因组计划最终要测定出由3×109 bp核苷酸组成的人基因组DNA的全部序列。随着全新测序技术与策略的参与,这项工作的进度大大加快,已远远超越了原定计划的时间表。; DNA分子标记的发展 1.限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism, RFLP) 第一代DNA标记,1980年提出来的 用同一个限制性核酸内切酶消化不同个体的同一段DNA时,会得到长度不同的限制性片段,称为RFLP。 ;2. 微

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