一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法.pdfVIP

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2023-05-12 发布于北京
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一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法.pdf

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本发明涉及抗生素耐药基因检测领域，公开了一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法，包括以下步骤：获取抗生素耐药基因的基因序列以及细菌菌株的全基因组测序数据，分别进行数据预处理识别核苷酸片段，得到核苷酸序列索引参考数据集C1和比对数据集C2；从参考数据集C1和比对数据集C2中分别获取指定长度的短核苷酸片段参考数据集S1和比对数据集S2；将参考数据集S1和比对数据集S2进行动态匹配；依据动态匹配结果，进行比对率计算；输出抗生素耐药基因检测结果。本发明的方法可以解决全基因组测序结果准确性较低以及抗

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114596916 A (43)申请公布日 2022.06.07 (21)申请号 202111616392.0 (22)申请日 2021.12.27 (71)申请人杭州电子科技大学地址 31001