一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法.pdfVIP

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2023-05-17 发布于北京
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一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法.pdf

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本发明公开了一种利用宏基因组分析溯源土壤耐药基因污染的方法，其步骤为：步骤一、构建非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤二、封装非冗余耐药基因集溯源数据库；步骤三、土壤样品DNA抽提和建库；步骤四、采用Illumina测序技术完成土壤样品的宏基因组测序；步骤五、对测序数据进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据；步骤六、对质控数据进行耐药基因定量分析；步骤七、不同样品的耐药基因丰度总体比较分析并可视化。本发明不仅可以用于宏基因组质控数据的ARGs物种溯源定量分析，还可以使用该数据库进行ARGs注释；

(19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 114822697 A (43)申请公布日 2022.07.29 (21)申请号 202210310443.5 (22)申请日 2022.03.28 (71)申请人南京农业大学地址 210095