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生物电子重排:指一组具有相关物理或化学性质的分子或基团,有相同的价电子数和排布。P108, Tab.4-3,书中也介绍了一些实例。实际上,我们已经遇到过很多这方面的实例。 新药的设计与开发第一节 药物作用的生物学基础 非特异性药物: 药理作用与结构类型关系较少。药理作用主要来源于简单的理化性质。特异性药物: 药物小分子与生物大分子有效结合,在立体空间上互补,电荷分布上匹配,引起构象改变,促发生化反应。 药物的创制,就是构建具有预期药理活性的新药(新化学实体, New Chemical Entity)。其特点就是: 周期长,风险大,回报丰厚。随着科学的发展,新药的创制也有过去的随机偶然发现,逐渐走向系统化,甚至可以通过药物分子设计(Molecular drug design)来简化和缩短药物开发过程。 药物作用的生物学靶点 受体(52%)、酶(22%)、离子通道(6%) 和核酸(3%)。已知靶点的数量约450个。 理化性质对药效的影响 主要讨论溶解度、分配系数和解离度对药物的吸收、转运进而对药效的影响。 1. 溶解度、分配系数对药效的影响 水是生物体的基本溶剂,体液、血液和细胞浆的主要组分是水。药物要扩散转运至血液或体液,必需有一定的水溶性。 而在转运的时候,药物必需跨越生物膜。 过大或过小的水溶性或脂溶性都不利于药物有效地发挥作用。以油水分配系数表征药物极性的大小。极性基团的引入可以增大药物的极性。 2. 解离度对药效的影响 药物以分子的形式通过生物膜,以离子的形式更易发挥作用。 酸性药物的吸收情况; 碱性药物的吸收情况。 二、新药开发的途径与方法 新药的创制,大体可以分成四个阶段:生物靶点的选择,检测系统的确定,先导化合物的发现,先导化合物的优化。 当导致疾病的病理过程中由某个环节或靶点被抑制或切断,即达到治疗的目的。所以靶点的选择是新药的起点。但如何利用分子生物学来发现诸如酶和受体等新靶点,就显得十分重要。 检测系统就是建立生物模型,在体内或体外,定性和定量地反映出药物对所选定的靶点的作用方式和程度,并与临床的病理过程相关。 以上两个方面是药理学为创制新药所作的必需准备。剩下的两个环节,则是药物化学的主要任务。 先导化合物(Lead compound, 又称原型物,或先导物),是通过各种途径或方法得到的具有某种生物活性的化学结构。先导物未必是好药。由于活性不很强,药动性质不合理,特异性不强,毒性大,不能作为药用,但为我们提供了可供改造的线索。 1、先导物的产生1.1 天然活性物 如从微生物资源的开发;从吗啡到合成镇痛药大伦丁;从红霉素到克拉霉素,阿齐霉素;从HMG-CoA还原酶抑制剂美伐他汀到其它他汀类。 2.生物化学为基础 从5-HT到非甾体抗炎药吲哚美辛;以组胺为化学起始物,寻找西米替丁,雷尼替丁和法马替丁等;从肾上腺素到其激动剂和拮抗剂等。 3. 基于临床副作用4. 基于生物转化 如从非那西丁到扑热息痛;保泰松的代谢活化;异丙嗪到氯丙嗪等强安定类。 4.药物合成中间体 如保肝作用的五味子丙素到联苯双酯。5.组合化学方法产生的先导物6.基于生物大分子结构和作用机理设计先导物 7.反义核苷酸 反义核苷酸能够与DNA或mRNA发生特异性结合,分别阻断核酸的转录或转译功能,则会阻止与病理过程相关的核酸或蛋白质的生物合成。这种能与DNA或mRNA结合的互补链称作反义寡核苷酸。 所以认为这类药物从根本上干预了遗传信息的复制,转录或翻译,理论上应为治本药物。 8.幸运发现的先导物 二、先导化合物的优化1. 剖裂法 当先导物为复杂结构如天然产物时,常常用此方法来优化结构。如五环系的吗啡,四环系的吗啡喃,二环系的哌替啶。 2. 类似物 这种方法更常用,即对先导物结构作局部变换或修饰。如改变分子的大小,设计同系物,引入双键的插烯规则,引入或出去手性中心,改变官能团以改变空间位阻,链状变环状或环状变链状等,柔性与刚性分子的变换,基团位置和方向的改变,分子的电荷分布状况的改变。
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