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2023-05-24 发布于四川
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一种植物与病原菌蛋白质相互作用的预测方法.pdf

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本发明涉及一种植物与病原菌蛋白质相互作用的预测方法，包括步骤：1)收集宿主‑病原菌蛋白质互作阳性数据；2)收集蛋白质复合体模板空间结构，分析亚基对的互作界面；3)将宿主‑病原菌蛋白质序列进行同源结构建模，获取蛋白质同源空间结构模型；4)将蛋白质同源空间结构与蛋白质复合体模板空间结构进行比对，获取结构特征；5)提取非结构特征；6)基于结构特征和非结构特征，搭建机器学习模型并测试调整，对基因组尺度的水稻‑稻瘟病菌蛋白质互作进行预测。与现有技术相比，本发明充分借助已测定的蛋白质结构数据，及同源、结构域

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112185459 A (43)申请公布日 2021.01.05 (21)申请号 202011020892.3 (22)申请日 2020.09.25 (71)申请人上海交通大学地址

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