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一种基于宏基因组数据分析微生物群体感应效应的方法,包括:在第一数据库和第二数据库中获取序列;将序列合并得到合并数据集;对合并数据集分类得到结构化数据集;对结构化数据集进行聚类分析,去除冗余序列;检查数据集中序列的注释,去除非群体感应基因序列;基于序列比对及系统发育学分析方法对数据集进行自校验,去除非群体感应基因序列;确定群体感应基因的保守性结构域或基元序列;检查保守性结构域或基元序列,去除不含保守性结构域或基元序列的序列;整合所有序列,构建群体感应基因数据库;将宏基因组数据在群体感应基因数据库中
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112365929 A
(43)申请公布日 2021.02.12
(21)申请号 202011117979.2
(22)申请日 2020.10.19
(71)申请人 北京大学
地址 10
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