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本发明提供了一种用于检测MSI的微卫星位点、其筛选方法及应用。其中筛选方法包括:选取≤15bp的A或T的单碱基重复序列且两翼序列相似值低于相似阈值的微卫星位点,记作第一位点集;获取多个MSS样本的测序数据并筛选统计出第一位点集中每个位点的重复单元的类型和每个重复单元的类型频率;选择满足第二条件的位点作为第二位点集,第二条件包括:1)频率最高的重复单元的类型与参考序列一致;2)在建库测序过程中的捕获效率高于捕获阈值;3)在人群中的多态性低于5%;统计并保留第二位点集中每个位点在阴性样本组和阳性样本
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利
(10)授权公告号 CN 112365922 B
(45)授权公告日 2021.06.15
(21)申请号 202110039459.2 (51)Int.Cl.
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