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归因分析笔记6 :SHAP代码笔记
⽬录
Python包:
该包的⽂档:
SHAP (SHapley Additive exPlanations)是⼀种归因⽅法attribution method, ⼀种描述特征影响模型平均⾏为的全局解释⽅法. 基于解
释单个预测的局部解释⽅法Shapley 值, 通过组合Shapley 值得到.
SHAP包的介绍参考:
SHAP多分类参考:
安装
pip install shap
or
conda install -c conda-forge shap
activate Liver
pip install shap
使⽤⽰例
Kernel SHAP的实现, 核 SHAP 是⼀种与模型⽆关的⽅法,⽤于估计任何模型的 SHAP 值。因为它不对模型类型做出假设,所以
KernelExplainer ⽐其他特定于模型类型的算法慢。
该例⼦解释iris数据集上的多分类 SVM
完整的notebook代码(解释scikit-learn中的6种模型):
import sklearn
import shap
from sklearn.model_selection import train_test_split
# print the JS visualization code to the notebook
shap.initj s()
# train a SVM classifier
X_train,X_test,Y_train,Y_test = train_test_split(*shap.datasets.iris(), test_size=0.2, random_state=0)
svm = sklearn.svm.SVC(kernel=rbf, probability=True)
svm.fit(X_train, Y_train)
# ⽤ Kernel SHAP解释测试集的预测
explainer = shap.KernelExplainer(svm.predict_proba, X_train, link=logit)
shap_values = explainer.shap_values(X_test, nsamples= 100)
其中explainer.shap_values(X_test, nsamples= 100)代表解释每个预测(单个测试样本)时重新评估模型的次数(见下⽅)
分别解释4个特征贡献, 从平均输出0.3206推向0.0 1
shap_values()
进⼊shap_values函数仔细看下:
作⽤: 估计⼀组采样的Shap值
输⼊参数
X : numpy.array or pandas.DataFrame or any scipy.sparse 矩阵
⽤于解释模型输出的样本矩阵
nsamples : auto or int
Number of times to re-evaluate the model when explaining each prediction. More samples lead to lower variance estimates
of the SHAP values. The auto setting uses `nsamples = 2 * X.shape[1] + 2048`.
解释每个预测(单个测试样本)时重新评估模型的次数。样本越多,Shap值的⽅差估计越低。设为auto代表使⽤
`nSamples=2*X.Shape[1]+2048`。
返回值
array or list
For models with a single output this returns a matrix of SHAP values (# samples x # features). Each row sums to the
difference between the model output for that sample and the expected value of the model output (which is stored as
expected_value attribute of the explainer). For models with vector outputs this returns a list of such matrice
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