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一种基于蛋白质序列比对的分子虚拟筛选方法,根据输入的待进行分子筛选的蛋白质序列,使用HHblits程序获取蛋白质的多序列联配信息;计算待预测的蛋白质序列和多序列联配信息对应位置出现相同残基的频率PSFM;使用同样的方法,生成蛋白质‑配体相互作用数据库BioLiP中每条蛋白质序列的PSFM;计算待预测蛋白质与BioLiP中每条蛋白质的残基对齐得分与相似度匹配质量,根据匹配质量得分取得潜在种子分子集;计算分子数据库中每个分子与种子分子集中的所有分子的二维指纹图谱值之和,根据得分对DrugBank中所
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112820355 A
(43)申请公布日 2021.05.18
(21)申请号 202011483191.3
(22)申请日 2020.12.16
(71)申请人 浙江工业大学
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