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本发明属于基因组测序技术领域，具体涉及一种基于二代数据的动物线粒体基因组组装方法。本发明组装方法包括如下步骤：首先通过profileHMM对庞大的数据进行快速筛选，获得潜在的线粒体编码DNA片段，然后，利用线性迭代算法对片段进行组装获取并利用profileHMM打分获得种子序列；最后，选用线性迭代的算法，快速从测序数据中将线粒体DNAreads组装到种子序列上，直至实现线粒体全基因组的组装。本发明实现了无需人工投递种子序列并实现快速、准确、完整组装线粒体基因组的目的，且对不同物种，数据量大
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 112802554 A
(43)申请公布日 2021.05.14
(21)申请号 202110120253.2
(22)申请日 2021.01.28
(71)申请人 中国科学院成都生物研究所
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