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2023-06-16 发布于浙江
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经典分子动力学模拟 CLASSICAL MOLECULAR DYNAMICS 4 Different disciplines focus on different length scales D.G. Pettifor, 1991 5 Illustration of the three levels of modeling of materials 第一性原理分子动力学定量构效 6 7 主要内容 ◼ 一、概念 ◼ 二、发展历史 ◼ 三、经典分子动力学（MD）介绍 ◼ 四、MD在纳米生物研究中的应用 8 9 物质基本构成单位：原子、分子微观世界宏观世界物质中能够独立存在的相对稳定并保持该物质物理化学特性的最小单元 DEFINITION Molecular dynamics (MD) ➢ a computer simulation method for studying the physical movements of atoms and molecules. ➢ a technique for computing the equilibrium and transport properties of a classical many- body system. 10 11 12 Classical MD ➢The atoms and molecules are allowed to interact for a fixed period of time, giving a view of the dynamic evolution of the system; ➢The trajectories of atoms and molecules are determined by numerically solving Newtons equations of motion for a system of interacting particles; ➢Forces between the particles and their potential energies are calculated using interatomic potentials or molecular mechanics force fields; ➢Applied today mostly in chemical physics, materials science and the mod