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一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法.pdfVIP

一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法.pdf

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    本发明公开了一种融合了单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，包括：基于全外显子测序数据及转录组测序数据通过软件进行质控、比对等步骤获取新生突变肽库；使用HLA分型预测软件预测HLA‑I类分型；结合单细胞TCR测序及单细胞转录组测序，通过细胞类型注释、克隆频率分析寻找癌症特异性的CD8+T细胞受体；同时，基于集成深度学习通过peptide‑TCR相互作用预测模型鉴定短肽免疫原性，提出融合单细胞TCR测序数据的肿瘤新生抗原筛选方法，解决了传统肿瘤抗原筛选方法新生抗原错选漏选率高、免疫原性不足等

    (19)国家知识产权局 (12)发明专利 (10)授权公告号 CN 113160887 B (45)授权公告日 2022.06.14 (21)申请号 202110443345.4 C12Q 1/6869 (2018.01)

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