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2023-06-16 发布于四川
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一种基于多种DNA序列编码方式和深度学习的6mA甲基化预测框架.pdf

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本发明公开了种基于多种DNA序列编码方式和深度学习的6mA甲基化预测框架，所述方法包括以下步骤：步骤1：获取含有6mA和不含6mA甲基化的DNA序列数据集；步骤2：分别使用Onehot、DBE、k‑mer、NCP四种DNA序列编码方式对数据集进行编码；步骤3：使用XGBoost分别对四种编码的特征进行特性选择；步骤4：构建深度学习模型，并使用蔷薇数据集训练，完成对深度学习模型的训练与优化；步骤5：将测试集数据输入训练好的深度学习进行预测。本发明使用了多种DNA序列编码方式和特征选择对DNA序列进

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113241119 A (43)申请公布日 2021.08.10 (21)申请号 202110515082.3 (22)申请日 2021.05.12 (71)申请人中南大学地址 41

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