理学微生物的分类鉴定.pptxVIP

理学微生物的分类鉴定;地球上开始出现生命，主要是些类似简单杆状 细菌的原始生物。;形成于35亿年前的微生物化石 主要是些类似简单杆状细菌的原始生物;形成于10亿年前的微生物化石;第5页/共60页;微生物分类学的基本任务： ;一 分类单元;二 种的概念 ;Bacillus subtilisASI.398;第10页/共60页;三 学名 ;2、三名法 ;四 微生物在生物界中的分类地位 ;1949年，六界：后生动物界、后生植物界、原生生物界* 、真菌界*、原核生物界* 、病毒界*； ;2、三域学说（三原界系统） ;五 各大微生物的分类系统 ;2000 年，Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 第二版编辑完成并分成 5 卷陆续出版。在此第二版中，细菌域分为 16 门， 26 组， 27纲，62目，163科，814 属，收集了4 727个种。古菌域分为2门，5组，8纲，11目，17科，63属，收集了208个种。供收集进原核微生物4 935个种。 ;2、菌物（真菌） ;第二节 微生物的分类鉴定 ;3、营养要求;生理生化特征;6、生态学特性;形态和生理生化特征是最常用 的细菌分类、鉴定指标;在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料， 都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。;二 现代指标 ;第26页/共60页;2）GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌 作出鉴定，并可检验表型特征分类的合理 性，从分子水平上判断物种的亲缘关系。;同一个种内的不同菌株G+C含量差别应在4～5%以下； 同属不同种的差别应低于10～15%； ;① 80年代以前螺菌属(Spirillum)不同种的G+C含量范围宽达38～66%，后来“伯杰氏手册”(1984)结合其他特征已将其分成三个属：螺菌属、海洋螺菌属(Oceanospirillum)和水螺菌属(Aquaspirillum) 它们G+C含量分别为38%、42～51%和49～66%；;在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，G+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。;2、核酸的分子杂交;1）DNA-DNA杂交；;第33页/共60页;第34页/共60页;特异性的探针主要用于 病原微生物的快速鉴定;3、电子杂交;蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化 速率相对恒定，也就是说，分子序列进化的改变量 (氨基酸或核苷酸替换数或替换百分率)与 分子进化的时间成正比。 ;16S rRNA被普遍公??为是一把好的谱系分析的“分子尺”：;核糖体RNA;第40页/共60页;利用16SrRNA建立分子进化树的美国科学家 Carl Woese ; rRNA和系统发育树;用反转录酶和双脱氧测序法对微生物培养物进行测序的步骤;a 代表16SrRNA的全长;2. 特征序列或序列印记（signature sequence）;定义3种生物领域的16S 或 18S rRNA的序列特征;3. 系统发育树(phylogenetic tree);16 S r RNA系统发育树;16S rRNA系统发育树;系统发育树;系统发育树;系统发育树;随着越来越多的微生物的全基因组序列的测定，人们发现 生物在进化中存在着非常广泛的水平基因转移现象，很多 科学家都认为不能仅靠对16SrRNA的序列比较来确定生物 之间的亲缘关系，还必须借助各种信息对这个进化树进行 改进。;指标有：细胞壁的氨基酸组分、全细胞的糖组分、细胞膜的类脂成份等。 ;四、其它;血清学试验 （凝集反应）;噬菌体分型;通过氨基酸顺序判断细菌间的亲缘关系;1. 为什么能用生物大分子作为衡量生物进化的标尺？有哪些选用原则？建立16 S r RNA系统发育树的意义何在？ 2. 为什么在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料，都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据？你知道有哪些项目已被用于细菌学分类和鉴定？;感谢观看!