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2023-06-17 发布于四川
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基于片段重叠群的单面基因组片段填充方法和装置.pdf

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本发明属于基因工程技术领域，提供了一种基于片段重叠群的单面基因组片段填充方法和装置，主要解决了缺失基因填充问题。该方法主要包括以下步骤：基于基因样本序列中各个元素之间组合产生公共邻接的数目不同，将基因元素分为三种类型：n‑Type‑1串、n‑Type‑2串和n‑Type‑3串，其中n为缺失基因串的长度；通过遍历两条基因序列，遍历计算获得缺失基因集合；通过构造二分图寻找1‑Type‑1串的最大匹配，将此类串插入相应位置并将此slot锁定；通过贪婪算法将n‑Type‑1串插入相应位置；合并最大缺失基

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 113257358 A (43)申请公布日 2021.08.13 (21)申请号 202110587796.5 (22)申请日 2021.05.27 (71)申请人山东建筑大学地址

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