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本发明公开了一种基于自监督学习的宏基因组重叠群分类方法。该方法包括:将序列划分为固定长度的重叠短序列;将各短序列视作词,获取序列所有的词,通过对不同的词进行数字编码,将字符型的序列转化为数值型序列,其中不同词组成的集合作为词典;将所述数值型序列输入经训练的自监督学习神经网络模型,提取序列特征;对所提取的序列特征进行降维,以映射到低维可分类特征空间,并利用聚类算法进行分类,获得分类结果。利用本发明能够提高宏基因组重叠群分类的效率和准确度。
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号 CN 113393898 A
(43)申请公布日 2021.09.14
(21)申请号 202110727538.2
(22)申请日 2021.06.29
(71)申请人 中国
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