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统计遗传学连锁分析; 连锁分析;连锁分析目的：;;一.?LOD score连锁分析;基本思想;or;1、假设重组率为;;;;建立检验假设：;结论：;在于对连锁的判断能力强，能确定连锁程度，适于呈孟德尔遗传、外显率高、纯一的单基因突变病分析 ;二.?数量性状连锁分析;Haseman-Elston 线性回归方法
;条件：;假设数量性状服从下面的模型 ;一对基因 A1 A2
基 因 型 A1A1 A1A2 A2A2
基因型值 +a d -a;: 基因型值;二、基因型相似程度描述;IBD/IBS;IBD：０、１、２;模型推导：;; 3.2用于标记位点的连锁分析的回归方程;;;Ａ/Ａ;基于上述原因;两位点ｔ，ｍ：;通过构造联合分布表可得，是重组率θ的函数;;3、多点连锁分析;两个位点的连锁分析目的主要是估算两个位点之间的重组率和检验两个位点之间是否连锁，可以用重组配子的频率来作为重组率的一个估计值，而重组配子的频率可以通过后代的重组个体的数量来计算。;;;;;?AB= r10+ r11;?AB= r10+ r11;例：;r10 =1/8 ;假设检验：;;;感谢您的欣赏
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