R程序包 rdacca.hp 在生态学数据分析中的应用_ 案例与进展.pdf

植物生态学报 2023, 47 (1): 134-144 DOI: 10.17521/cjpe.2022.0314 Chinese Journal of Plant Ecology R程序包“rdacca.hp”在生态学数据分析中的应用: 案例与进展 1,2 3,4 5 6 1,3,7* 刘 尧 于 馨 于 洋 胡文浩 赖江山 1南京林业大学生物与环境学院, 南京 210037; 2 厦门大学环境与生态学院, 福建厦门 361102; 3 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验 室, 北京 100093; 4 中国科学院大学, 北京 100049; 5北京林业大学水土保持学院, 北京 100083; 6浙江农林大学风景园林与建筑学院, 杭州 311300; 7 南京林业大学数量生态学研究中心, 南京 210037 摘 要 定量评估不同变量对群落组成的贡献是群落生态学分析的热点问题。但在具体的分析情景中, 因子间的共线性与解 释率的重叠对评估不同因子重要性造成了较大困难。基于这一问题, R程序包“rdacca.hp”通过引入层次分割法(HP) 的理念, 在 所有可能的模型子集下为各解释变量(或解释变量组)分配单独效应, 为典范分析中共线性解释变量的相对重要性评估提供了 新的定量指标。目前, “rdacca.hp”包已经成为群落生态学分析的重要工具。为进一步促进用户对“rdacca.hp”包的理解与运用, 该文通过引入一个分析塑造甲螨(Oribatida)群落的重要环境和空间驱动因素的实例, 重点展示了使用该程序包进行典范分析 的一般步骤。随后对近期应用“rdacca.hp”包开展分析的相关研究进行文献计量学分析, 结果表明该程序包自上线以来已被广 泛用作解决生态学、环境科学及相关学科问题的基本定量框架。最后, 该文对“rdacca.hp”包的未来应用和升级进行了展望。 总之, 该文旨在使国内学者们进一步加深对“rdacca.hp”包的认识和应用。 关键词 “rdacca.hp”包; 典范分析; 相对重要性; 层次分割; 群落组成 刘尧, 于馨, 于洋, 胡文浩, 赖江山 (2023). R 程序包“rdacca.hp”在生态学数据分析中的应用: 案例与进展. 植物生态学报, 47, 134-144. DOI: 10.17521/cjpe.2022.0314 Application of “rdacca.hp” R package in ecological data analysis: case and progress 1,2 3,4 5 6 1,3,7* LIU Yao , YU Xin , YU Yang , HU Wen-Hao , and LAI Jiang-Shan 1College of Biology and the Environment, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China; 2School of Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen, Fujian 361102, China;