SN_T 4877.10-2017基因条形码筛查方法 第10部分：检疫性疫霉.pdf

SN中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 4877.10—2017基因条形码筛查方法第10部分：检疫性疫霉DNA barcoding screening method-Part 1O :Quarantine Phytophthora2017-08-29 发布2018-04-01实施中华人民共和国发布0国家质量监督检验检疫总局涂！ SN/T 4877.10—--2017前言SN/T4877《基因条形码筛查方法》分为10部分：第1部分：检疫性棒形杆菌；第2部分：检疫性黄单胞菌；第3部分：检疫性植原体；第4部分：检疫性茎点霉；-第5部分：检疫性拟茎点霉；-第 6部分:检疫性嗜酸菌;第7部分：检疫性轮枝菌；第8部分：检疫性炭疽菌；第9部分：检疫性腥黑粉菌；第10部分：检疫性疫霉。本部分为SN/T4877的第10部分。本部分按照GB/T1.1--2009给出的规则起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。本部分由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本部分起草单位：中华人民共和国深圳出入境检验检疫局、深圳市检验检疫科学研究院。本部分起草人：章桂明、高瑞芳、汪莹、程颖慧、王颖、黄河清。T SN/T 4877.10—2017基因条形码筛查方法第10部分：检疫性疫霉1范围SN/T 4877的本部分规定了栗疫霉黑水病菌、马铃薯疫霉绯腐病菌、草莓疫霉红心病菌、树莓疫霉根腐病菌、柑橘冬生疫霉、雪松疫霉根腐病菌、首藉疫霉根腐病菌、菜豆疫霉病菌、栎树猝死病菌、大豆疫霉病菌和丁香疫霉病菌的 DNA条形码筛查。本部分适用于栗疫霉黑水病菌、马铃薯疫霉绯腐病菌、草莓疫霉红心病菌、树莓疫霉根腐病菌、柑橘冬生疫霉、雪松疫霉根腐病菌、首藉疫霉根腐病菌、菜豆疫霉病菌、栎树猝死病菌、大豆疫霉病菌和丁香疫霉病菌的DNA条形码筛查种序列的扩增、分析及结果判定等。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件，其必威体育精装版版本（包括所有的修改单)适用于本文件。SN/T 1131大豆疫霉病菌检疫鉴定方法SN/T1135.6马铃薯腐病菌检疫鉴定方法SN/T 2080栎树猝死病菌检疫鉴定方法SN/T 2474大豆疫霉病菌实时荧光 PCR 检测方法SN/T 2617冬生疫霉病菌检疫鉴定方法SN/T 2756丁香疫霉检疫鉴定方法SN/T 2759栗黑水疫霉病菌检疫鉴定方法SN/T 3403菜豆疫霉检疫鉴定方法3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1DNA 条形码DNA barcode生物体内能够代表该物种的，标准的、有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段。3.2线粒体细胞色素 C 氧化酶亚基 I基因mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I，CO I线粒体基因变化速率快，在其13个蛋白编码基因中,CO1基因很少存在插人缺失，序列长度500 bp~～700 bp，宜作为真菌 DNA条形码，也是最早提出的DNA条形码片段。3.3内部转录间隔区序列J internal transcribed spacer; ITS在真核生物中,核糖体 DNA是由核糖体基因及与之相邻的间隔区组成,其基因组序列从 5到 3依次为：外部转录间隔区、18S基因、内部转录间隔区1（ITS1）、5.8 S基因、内部转录间隔区2(ITS2)、28 S基因和基因间隔序列。内部转录间隔区是存在于18SrDNA、5.8SrDNA 和28SrDNA之间的区黑 SN/T 4877.10—2017域，ITS1和ITS2作为非编码区，受外界环境因素的影响较小，与编码区域相比具有进化速度快的特点，在种内的不同菌株之间高度保守，而在真菌种间存在极大的变化，表现出极大的序列多态性，能够提供详尽的系统学分析所需的可遗传性状。4检疫性疫霉基本信息学名 : Phytophthora cambivora(Petri)Buisman中文名:栗疫霉黑水病菌学名: Phytophthora erythroseptica Pethybridge中文名：马铃薯疫霉绯腐病菌学名: Phytophthora fragariae Hickman中文名：草莓疫霉红心病菌学名:Phytophthora fragariae Hickman var.rubi W.F.Wilcox et J.M.Duncan中文名:树莓疫霉根腐病菌学名:Phytophthora hibernalis Carne中文名:柑橘冬生疫霉学名:Phytophthora lateralis Tucker et Milbrath中文名：雪松疫霉根腐病菌学名: Phytophthora medicaginis E.M.Hans