SN_T 4625-2016DNA条形码筛选与质量要求.pdf

SN中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 4625—2016DNA条形码筛选与质量要求Principles of screening for DNA barcode quality elements2016-08-23发布2017-03-01实施中华人民共和国司发布国家质量监督检验检疫总局 中华人民共和国出人境检验检疫行业标准DNA条形码筛选与质量要求SN/T4625—2016*中国标准出版社出版北京市朝阳区和平里西街甲2号（100029）北京市西城区三里河北街16号（100045)总编室：（010址中国标准出版社秦皇岛印刷厂印刷*开本880×12301/16印张0.5字数10千字2017年12月第一版2017年12月第一次印刷印数1—500*书号：155066·2-32284定价14.00元 SN/T4625—2016前言本标准按照GB/T1.1一2009给出的规则起草本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准起草单位：中国检验检疫科学研究院。本标准主要起草人：陈岩、宋云、陈克、赵文军、吴绍强、朱水芳。I SN/T4625—2016DNA条形码筛选与质量要求1范围本标准规定了我国检疫性有害生物DNA条形码数据的筛选原则与质量要求。本标准适用于我国检疫性有害生物DNA条形码鉴定系统中的DNA条形码数据。2术语和定义下列术语和定义适用于本文件。2.1DNA条形码DNAbarcodes一段短的、标准化的基因片段，用于区分不同的物种。该片段在种间存在明显的遗传变异和分化并容易进行PCR扩增。注：DNA条形码技术主要用于物种识别和新种发现。2.2凭证标本voucher specimensDNA条形码的实物参考凭证。注：凭证标本信息包括馆藏信息、采集信息、鉴定信息，用于复核。模式标本是用于分类学研究的凭证标本。33DNA条形码筛选原则3.1物种识别率高，种间具有明显遗传变异和分化，而种内变异较小。3.2引物通用性强，存在保守区，便于设计通用引物。3.3基因片段较短，易于PCR扩增与测序，也易于扩增降解DNA。4DNA条形码数据要素包括物种名称、凭证标本信息、采集记录、鉴定人、DNA条形码、PCR引物和序列峰图7个要素。b5DNA条形码的样品要求国际生命条形码协会要求每个物种至少选取10个样品、每种选取5个地理种群，每个种群选取2个个体。每个物种选取1个近缘种（至少2个样品）。6凭证标本要求凭证标本至少采集3份，用于物种鉴定和国内外标本馆间的交换。主要包括馆藏信息（标本存放地、标本号）、采集信息（采集者、采集日期、采集地点）和鉴定信息（拉丁学名、中文名、鉴定日期、鉴定人）。1 SN/T4625—20167已有DNA条形码7.1动物：CO1。7.2植物：rbcL，matK，trnH-psbA，ITS2。7.3真菌：ITS,LSU。8已有DNA条形码部分通用引物参见附录A。9新DNA条形码要求9.1已有DNA条形码在研究类群中无效9.2研究人员收集了大量候选DNA条形码数据。候选DNA条形码能提供足够的变异以识别物种9.39.4容易进行PCR扩增。9.5引物通用性强。S2 SN/T4625—2016附录A（资料性附录）已有DNA条形码部分通用引物已有DNA条形码部分通用引物如表A.1所示。表A.1已有DNA条形码部分通用引物退火温度应用类群DNA条形码引物引物序列（5-3）50℃动物LCO1490GGTCAACAAATCATAAAGATATTGGCO150 ℃动物HC02198TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA52 ℃真菌ITS5GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGITS52 ℃真菌ITS4TCCTCCGCTTATTGATATGC48 ℃真菌LRORACCCGCTGAACTTAAGCLSU48 ℃真菌LR5TCCTGAGGGAAACTTCG55 ℃植物rbcLa-FATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCrbcL55 ℃植物rbeLa-RGTAAAATCAAGTCCACCRCG48 ℃植物matK-390F CGATCTATTCATTCAATATTTCmatK48 ℃植物TCTAGCACACGAAAGTCGAAGTmatK-1326R55 ℃植物psbAGTTATGCATGAACGTAATGCTCtrnH-psbA55 ℃植物trnHCGCGCATGGTGGATTCACAATCC55 ℃植物ITS-S2FATGCGATACTTGGTGTGAATITS255 ℃植物ITS4TCCTCCGCTTATTGATATGC SN/T4625—2016SLUC参考文献[1J Tautz D.,Arctander P., Minelli A.et al.A plea for DNA