第四章计算机图形化技术在化学中的应用.ppt

第四章计算机图形化技术在化学中的应用;化学化工领域内涉及图形化技术的领域;Q:计算机如何绘制图形？ 屏幕的构成？图形的描述方法？图形化语言？ Q：计算机图形的基本要素有哪些？ 位置描述（坐标系）？灰度描述？色度描述？ Q:分子结构也是一种图形，有什么特点？利用计算机技术完成分子结构绘制都可以使用哪些方法？ Q:根据资源占用、使用方便、功能全面等角度考虑，分析不同方法的优劣。 如何用占用资源最少，记录信息量最大，失真最小的方式描述一个分子结构？;计算机图形格式： 计算机平面静态图形文件分为两大类： 一类是位图，在编辑位图时针对的是像素点而不是形状，位图放大会产生失真，存储时占较大空间； 一类是由函数集描述图像，占有少量空间及内存，因为是用数学函数描绘的，放大不会失真，但比较复杂的图像运算量非常大。 ;常见计算机图形格式及其特点;⑹TIF （Tag Image File Format） ―是一种跨平台的位图格式, 采用的LZW压缩算法是一种无损失的压缩方案，常用来存储大幅图片。 ⑺.PCX―是一种跨平台格式, 是Windows与DOS之间进行图形文件交换的桥梁。 ⑻.TGA―是Windows与3DS进行图形交换的格式。在实用中可以将动画通过视频软件转入电视。 ⑼.WMF (Metafile) ―是一种清晰简洁的矢量图形格式, 无论放大还是缩小，图形的清晰度不变， 用于Word中。 ⑽.EPS――Adobe公司绘图软件Illustrator的矢量图格式，EPS格式常用于位图与矢量图之间交换文件。;几种常见化学结构文件格式;第八页，共二十九页，2022年，8月28日;第九页，共二十九页，2022年，8月28日;A connection table (Ctab) contains information describing the structural relationships and properties of a collection of atoms. The atoms may be wholly or partially connected by bonds. Such collections may, for example, describe molecules, molecular fragments, substructures, substituent groups, polymers, alloys, formulations, mixtures, and unconnected atoms. The connection table is fundamental to all of MDL’s file formats.;常用化学图形化软件种类;第一节 化学办公软件;分子结构式绘制软件ISISDraw的功能与应用;ISISDraw软件的使用;ChemSketch 软件的功能与应用;ChemSketch 软件的使用性能;Chemsketch软件的实际应用;Chemoffice软件简介;软件的主要功能;软件的主要界面;;第二节 计算机辅助建立分子结构模型;常见的分子模型演示软件;DS Viewer Pro 分子分析演示软件;显示分子模型：棒状、球棒状、空间填充状，生物大分子显示方法，矿物晶体显示方法，模拟电子显微镜下状态。 分子结构分析：分子（晶胞、蛋白质等），链段（肽链，核酸链等），链组成（氨基酸、核酸等），原子组成，化学键组成。 结构参数测定：键长、键角、两面角、分子组成等。 常见各类分子模型库：DNA片断，与环境相关的物质，无机化合物，材料类物质，天然产物类，石油产品类，药物类，蛋白质类，小分子类，一般化合物类。 分子模型的输出如输入方法：输出格式：.msv,PDB格式，MDL格式，XYZ坐标格式，VRML格式，GIF格式，JPEG格式，BMP格式等13种。输入格式共18种。 ;DS Viewer Pro软件的安装与使用;DS Viewer Pro 软件的使用方法介绍;第四章思考题;第四章练习题第四章计算机图形化技术在化学中的应用;化学化工领域内涉及图形化技术的领域;Q:计算机如何绘制图形？ 屏幕的构成？图形的描述方法？图形化语言？ Q：计算机图形的基本要素有哪些？ 位置描述（坐标系）？灰度描述？色度描述？ Q:分子结构也是一种图形，有什么特点？利用计算机技术完成分子结构绘制都可以使用哪些方法？ Q:根据资源占用、使用方便、功能全面等角度考虑，分析不同方法的优劣。 如何用占用资源最少，记录信息量最大，失真最小的方式描述一个分子结构？;计算机图形格式： 计算机平面静态图形文件分为两大类： 一类是位图，在编辑位图时针对的是像素点而不是形状，位图放大会产生失真，存储时占较大空间； 一类是由函数