高通量测序 应用.pdf

高通量测序 应用 11 第1页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序的的用用途途 22 第2页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序的的用用途途 基因组序列的物种进行重测序，鉴定SNP， indel及基因组结 变化；对含有全基因组序列 且转录本注释较好的物种开展转录组学研究， 解析细胞转录产物的数量变化及其结 信息。 33 第3页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序现现状状 第二代测序技术，又称超高通量测序。目前， 科学家正为1000美元完成 个基因组测序而努 力。多家研究单位正在为此展开竞争，而且进 展比预期的更快。 44 第4页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序原原理理 高通量测序方法原理示意图 55 第5页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序平平台台 高通量测序的三大平台： Illumina公司的Solexa测序仪 ， 罗氏公司( oche)的454 测序仪 ， ABI公司的SOLiD 测序仪 66 第6页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序特特点点 速度快 通量高 结果一致性好 简便高效 77 第7页，共15页，2022年，5月20日，1点分，星期五 高高通通量量测测序序在在基基因因组组上上应应用用 应用于人基因组重测序 动植物、细菌基因组测序 88 第8页，共15页，2022 ，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序在在mmRRNNAA表表达达谱谱的的应应用用 将miRNA的标记与线性放大相结合，只 要几 皮克纯化的miRNA就能获得高敏感度的miRNA 芯片表达谱。 99 第9页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序在在mmiiccrrooRRNNAA中中的的应应用用 高通量、低成本 易于寻找新片段 作用位点 1100 第10页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序在在CCHHIIPP--CCHHIIPP的的应应用用 相对refseq，染色质免疫沉淀以 的DNA直接 进行测序,可以直接获得蛋白与DNA结合的位点 信息 相对ChIP-chip,ChIP-seq可以检测更小的结合 区段、未知的结合位点、结合位点。 1111 第11页，共15页，2022年，5月20日，1点9分，星期五 高高通通量量测测序序在在甲甲基基化化的的应应用用 对于DNA甲基化的检测，目前采用：甲基化 DNA富集并结合高通量测序 ，可 检测到全基 因组范围内的甲