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第四章 染色体( 图2—1),从DNA到核小体,DNA长度在核小体这个等级上压缩了7倍。
对核小体核心颗粒的结构是从不同的角度进行研究的,目前对其形态和5种组蛋白的氨基酸组成已经比较清楚。但对它的内部结构还有许多不明确的地方,为了研究4种组蛋白在核心颗粒中的排列方式,用某些交联剂处理染色质或提纯核心体,然后用电泳法分离出组蛋白的寡聚体,结果发现有H2b与H4、H2a与H2b、H3和H4等三种排列方式。因此,在核小体中组蛋白的连接顺序应为H2a—H2b—H4—H3,基于这些观察,学者们提出了多种结构模型。
1.Kornberg模型
该模型是由Kornberg于1974年提出,1997年又做了补充( 图2—2)。其要点如下:
①染色质纤维是由许多核小体(nucleosome)重复串联而成,每个核小体由核心颗粒(core particle)与连结区两部份组成。
②每个核心颗粒由H2a、H2b、H3、H4各两个分子的八聚体组蛋白核心和140bp的DNA组成。
③连结区的DNA长度为15~100bp,并与组蛋白H1相结合。
④DNA按某种至今尚未肯定的方式缠绕于八聚体周围,形成了一个直径约为100?的近似球型的颗粒。这些颗粒沿染色质纤维长轴紧密地排列。
上述Kornberg模型有三个特点:①Kornberg认为按照用X光衍射晶体法测定的所有分子量为10 000~20 000的组蛋白的结构来推论,组蛋白应该是球形的;②核小体在结构上是致密的,即核心颗粒和连结区DNA都是卷曲折叠的;③连结区不是伸展的,对核酸酶很敏感。
2.Weintraub模型
Weintraub等于1976年提出了核小体的动态结构模型( 图2—3)。按此模型,每个组蛋白八聚体核心是由两个环状异型四聚体H2a—H3—H4—H2b构成。每个四聚体含H2a、H2b、H3、H4各一个分子,这样的四聚体与所联结的DNA在一起构成对称的核小体单体,称之为半核小体(half nucleosome)。因此,每个核小体由两个半核小体组成,形成二元轴结构。
在一定条件下,核小体中的两个半核小体可以呈松缓状态,甚至伸展状态,也可以互相紧密结合在一起。他们认为,这种动态变化对于染色体复制、基因表达等染色质功能的实现是非常重要的。
3.Finch模型
Finch等(1977)用电镜和X-射线衍射技术研究了核小体核心的结晶,进一步发展了Kornberg模型,认为:
①核小体核心并不呈圆球形,而是比较近似一个短的圆柱体,即110?×110?×57? 的扁圆形球体。DNA长度为146bp,左向盘绕组蛋白八聚体大约1.75圈,间距28 ? ,旋转直径110 ? ( 图2—4)。
②核小体的核粒之间的连接丝变动于20~100bp之间,因此每个亚单位的DNA总长度为166~246bp。
③与Weintraub模型一样,核小体沿其短轴分为对称的两半,即由两个半核小体组成。
4.Li模型
Li(1975)认为H2a、H2b、H3、H4组成的八聚体亚单位在与DNA双螺旋结合前是平行伸展的,而不是球状或粒状。当八聚体与DNA结合后,因所处条件不同,以及组蛋白分子之间的相互作用,可使DNA链处于伸展、超螺旋或球状。
组蛋白分子是先形成四个平行的二聚物(H2a)2、(H2b)2、(H3)2、(H4)2,然后通过C末端的疏水键,形成(H2a)2(H2b)2、(H3)2(H4)2两个四聚体,最后形成(H2a)2(H2b)2(H3)2(H4)2八聚体,并与组蛋白H1构成组蛋白亚单位,亚单位进一步与DNA结合。在DNA双螺旋上,八聚体中组蛋白之间的非极性作用使DNA双螺旋链更加弯曲,最后形成球形的致密结构。
Li模型的特点是:①认为球状结构只是亚单位的存在状态之一,而不是唯一的存在状态;②Li模型中有一段DNA是与H1相结合,并且没有其他组蛋白,而象Kornberg模型,H1是与组蛋白八聚体相联的;③Li模型中,在两个八聚体之间有一细的连线,即H1与DNA结合的区域,而在Kornberg模型中则没有。
5.Chai模型
Chai和Sanberg(1980,1982)通过对中国仓鼠细胞的染色质和染色体的研究结果,以及其他关于染色质的生化和超微结构的资料,提出了一个关于核小体的新模型。认为:
①核小体核心的八聚体组蛋白是由两部分组成,他们大体上相当于Weintraub模型中的半核小体,即每一部分都是由H2a、H2b、H3和H4各一个分子组成的四聚体。两个四聚体侧面观察似一对并列的板状物,正面观察核小体呈近六角型。DNA盘绕在八聚体的外侧。
②组蛋白H1并非完全在核小体核心之外,而是与八聚体核心结
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