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全自动核酸提取简介 本文档共70页;当前第31页;编辑于星期三\0点50分 本文档共70页;当前第32页;编辑于星期三\0点50分 本文档共70页;当前第33页;编辑于星期三\0点50分 本文档共70页;当前第34页;编辑于星期三\0点50分 本文档共70页;当前第35页;编辑于星期三\0点50分 本文档共70页;当前第36页;编辑于星期三\0点50分 RT-PCR反应条件: 50℃ 40分钟; 94℃ 5分钟; 94℃ 30秒,50℃ 40秒,65℃ 50秒,35个循环; 65℃ 10分钟。 (总时间约170分钟) 本文档共70页;当前第37页;编辑于星期三\0点50分 电泳分析结果 用1 ×TAE配制2%的琼脂糖凝胶,加热融解后,加入GOLDVIEW(5uL/100mL),待凝胶冷却至50~70℃左右,倒入胶槽,等胶凝固后放在电泳装置上; 在帕拉膜(Parafilm)上加上6 × 电泳载样缓冲液(每个反应需1μl)。再加上5μl的PCR反应产物与之混合; 将电泳缓冲液倒在电泳装置中,用吸尖将样品与载样缓冲液的混合溶液加到孔中; 盖上盖子,接通电源,以 5V/cm 电压(恒定电压)电泳,大约35-40min,直到溴酚蓝跑到凝胶的底部的时候,停止电泳; 本文档共70页;当前第38页;编辑于星期三\0点50分 5. 在紫外透射仪下观察PCR产物电泳结果,并照相作记录。 本文档共70页;当前第39页;编辑于星期三\0点50分 RT-PCR 质量控制 提取RNA:选择一个EV71阳性标本同时提取作对照; PCR扩增:选择至少一个EV71阳性标本RNA同时扩增作对照; 电泳分析:选择合适的Marker (500~1000bp) 本文档共70页;当前第40页;编辑于星期三\0点50分 实时荧光定量PCR技术 实时荧光定量PCR定义: 在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实现了实时监测整个PCR进程,对起始 模板进行定量分析的方法。 本文档共70页;当前第41页;编辑于星期三\0点50分 分类(DNA 产物的荧光标记):非特异性荧光标记:1、SYBR Green 特异性荧光标记:2、TaqMan3、分子信标 (Molecular Beacon) 本文档共70页;当前第42页;编辑于星期三\0点50分 TaqMan---水解型杂交探针 5′端标记有报告基团(Reporter, R) ,如FAM、VIC等; 3′端标记有荧光淬灭基团(Quencher, Q); 探针完整,R所发射的荧光能量被Q基团吸收,无荧光,R与Q分开, 发荧光; Taq酶有5′→3′外切核酸酶活性,可水解探针。 本文档共70页;当前第43页;编辑于星期三\0点50分 TaqMan法工作原理 本文档共70页;当前第44页;编辑于星期三\0点50分 TaqMan PCR体系的构成: 引物、TaqMan探针、 dNTPs、 Taq聚合酶、 模板、 相应的缓冲体系等。 本文档共70页;当前第45页;编辑于星期三\0点50分 典型的Real time PCR四阶段: 本文档共70页;当前第46页;编辑于星期三\0点50分 荧光阈值(threshold)设定: threshold = 10×SD(cycle 6-15) 本文档共70页;当前第47页;编辑于星期三\0点50分 Ct值: C代表Cycle, t代表threshold,即每个反应管内的荧光信号到达设定的阈值时所经历的循环数。 本文档共70页;当前第48页;编辑于星期三\0点50分 荧光定量PCR标准曲线绘制: 本文档共70页;当前第49页;编辑于星期三\0点50分 结果分析条件设定和结果判断: 对照结果:阴性对照应为阴性;阳性对照应为阳性; Ct值无数值的(与阴性对照应一致)标本为阴性样本; Ct值≤35.0的样本为阳性; Ct值≥35.0的样本建议重做。重做结果无数值者为阴性, 否则为阳性。 本文档共70页;当前第50页;编辑于星期三\0点50分 荧光PCR特点 灵敏度高 特异性强 全封闭PCR过程,无需后处理,降低污染机会。 即时反映扩增过程,更适用于定量。 可实现一管多检(如:双通道、三通道检测) 仪器自动分析,更快获得结果。 探针设计有一定难度,较难达到一管多检的要求。 出现污染,更难处理。 本文档共70页;当前第51页;编辑于星期三\0点50分 传染病暴发疫情应急检测 本文档共70页;当前第1页;编辑于星期三\0点50分 一、实验室检测在传染病疫情中的作用 公共卫生 疾病预防控制 体系 应急反应 体系 医疗救助 体系 卫生监督 执法体系 四个体系 教育培训 人才队伍 公共卫生立法 运行保障 科研 工作依托 ——国家突发公
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