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人类胰岛淀粉样多肽20-29片段早期聚集的分子动力学模拟研究的中期报告
本研究旨在通过分子动力学模拟研究人类胰岛淀粉样多肽20-29（hIAPP20-29）片段聚集的早期阶段，以揭示该片段聚集机制的分子机理。
首先，我们使用GROMACS软件建立了两个模拟系统，分别模拟hIAPP20-29单体和6个hIAPP20-29分子的聚集。然后，我们进行了长达100纳秒的分子动力学模拟，观察聚集早期的构象和动力学变化。我们还计算了系统的径向分布函数、配位数和氢键分析，以进一步研究聚集行为。
初步结果显示，hIAPP20-29片段在单体状态下保持较为均匀的构象，但在聚集过程中出现了一些局部氢键和π-π堆积相互作用，促进了分子之间的近距离交互。同时，我们观察到了一些初期的聚集核心，包括双分子和三分子构象。在多分子聚集过程中，我们发现形成了两个较为稳定的聚集结构，即锥形聚集和球形聚集，这两种形态都是通过π-π相互作用驱动形成的。
总之，我们的研究表明，hIAPP20-29片段聚集的早期阶段是通过局部氢键和π-π相互作用促进的，并形成了多种构象。这些结果有助于深入理解该片段聚集机制的分子细节，同时也为将来研究hIAPP相关代谢疾病的治疗提供了理论基础。
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