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本发明属于计算机辅助药物设计技术领域,公开了一种蛋白质‑配体相互作用预测方法及优化方法。本方法包括:构建数据集,制作标签数据;建立蛋白质‑配体复合物模型,将蛋白质‑配体编码成蛋白质结合口袋图和蛋白质‑配体原子交互图,蛋白质‑配体原子交互图即异构图;异构图包括两类节点和四种边;构建基于边的图注意力网络打分模型,包括特征提取模块和两个解码器;训练打分模型;用训练好的打分模型预测配体结合姿态均方根偏差RMSD和蛋白质‑配体结合强度pkd。本发明的打分模型能同时预测配体结合姿态均方根偏差RMSD和结合强
(19)国家知识产权局
(12)发明专利申请
(10)申请公布号CN117275610A
(43)申请公布日2023.12.22
(21)申请号202311459177.3G06N3/08(2023.01)
(22)申请日2023.11.0
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