DB65T 4091-2018LAMB1基因rs159769941 SNP位点辅助评定细毛羊羊毛自然长度的分子检测技术规程.docx

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ICS65.020.30

B43

DB65

新疆维吾尔自治区地方标准

DB65/T4091—2018

LAMB1基因rs159769941SNP位点辅助评定

细毛羊羊毛自然长度的分子检测技术规程

TechnicalspecificationofmoleculardetectionforLAMB1Geners159769941SNPAssistedEvaluationinFine-WoolSheepwithWoolStapleLength

2018-1-25发布 2018-2-25实施

2018-1-25发布

新疆维吾尔自治区质量技术监督局发布

I

DB65/T4091—2018

前言

本标准根据GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准的结构和编写》要求编写。

本标准由新疆维吾尔自治区畜牧厅提出并归口。

本标准由新疆农业大学和新疆畜牧科学院畜牧研究所负责起草。

本标准主要起草人:黄锡霞、田可川、赵冰茹、王旭光、狄江、田月珍、徐新明、付雪峰、吴伟伟、哈尼克孜、何军敏、阿布来提·苏来曼、朱桦、陈华峰、杜建文。

1

DB65/T4091—2018

LAMB1基因rs159769941SNP位点辅助评定细毛羊羊毛自然长度的分子检测技术规程

1范围

本标准规定了LAMB1基因rs159769941SNP位点辅助鉴定细毛羊羊毛自然长度的分子检测方法的原理、主要试剂和溶液配制、仪器设备及耗材、检测方法、结果判定、废弃物处理和防止污染的措施。

本标准适用于LAMB1基因rs159769941SNP位点辅助鉴定细毛羊羊毛自然长度的分子检测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其必威体育精装版版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T6682分析实验室用水规格和实验方法

GB/T19915.9猪链球菌2型溶血素基因PCR检测方法

SN/T1193基因检验实验室技术要求

3术语和定义

下列术语和定义适用于本文件。

3.1

层粘连蛋白β1基因laminin-beta-1gene

层粘连蛋β1基因(laminin-beta-1,LAMB1)由细胞外基底膜异源三聚体的糖蛋白组成,定位在绵羊4号染色体上,由33个外显子组成,编码1953个氨基酸,存在于血清中,参与细胞附着和趋化作用,可能通过其那1链绑定层粘连蛋白受体。LAMB1作为血管基底膜和细胞外基质的主要功能成分,在细胞粘附迁移、胚胎发育、血管生成、组织分化等生物过程中发挥重要作用。LAMB1主要通过与细胞上的各种受体结合而发挥作用,大多数受体是整合素家族成员之一,介导细胞与基质和细胞与细胞之间的黏附。LAMB1基因rs159769941SNP位点发生了突变,导致所编码的氨基酸由亮氨酸(L)变成脯氨酸(P)。研究表明,该突变与细毛羊羊毛的自然长度性状密切相关,当基因型为TT型时,则待测细毛羊属于羊毛自然长度长的细毛羊;当基因型为TC型或CC型时,则待测细毛羊属于羊毛自然长度短于TT基因型的细毛羊。

3.2

细毛羊fine-woolsheep

被毛同质、羊毛纤维平均直径25μm以下的毛用绵羊品种。

2.3

2

DB65/T4091—2018

羊毛纤维自然长度woolstaplelength(WSL)

自然状态下,受测羊只体表毛纤维从毛根到毛稍的距离。

2.4

单核苷酸多态性singlenucleotidepolymorphism(SNP)

是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。

2.5

聚合酶链式反应polymerasechainreaction(PCR)

一种用于在体外扩增DNA序列的技术程序。模板基因序列先经高温变性成为单链,在DNA聚合酶的作用和适宜的反应条件下,根据模板序列设计的两条引物分别与模板DNA两条链上相应的一段互补序列发生退火而相互结合,接着在DNA聚合酶的作用下以四种脱氧核糖核苷酸(dNTP)为底物,使引物得以延伸。然后不断重复变性、退火和延伸这一循环过程,使欲扩增的基因片段呈几何倍数扩增。

2.6

单链构象多态性singlestrandconformationpolymorphism(SSCP)

是根据单链DNA片段在非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳中所呈现的不同带型来检测基因突变

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