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中文摘要
2021年吉林省对朝口岸地区鼠类本底调查及其遗传特征研究
目的:
了解吉林省对朝口岸地区鼠类的种类构成、密度情况,确定吉林省对朝口岸地区
鼠类分布情况,为该地区鼠种的输入性变化提供重要的数据支持。使用DNA条形码
技术对鼠类和鼠类残缺样本进行鉴定,获得该地区鼠类的DNA条形码信息,为鼠类
的准确鉴定提供进一步数据支持。
方法:
20216-11
年月月,选择吉林省对朝口岸地区内的珲春、长白、通化、延吉四个
口岸下的口岸生活区、农田、林地生境监测地点,采用夹夜法捕获鼠类,每个生境共
布置鼠夹1000夹,各口岸各共布置鼠夹3000夹。对鼠类进行分类及形态鉴定,同时
利用DNA条形码技术进行鉴定:具体为解剖取鼠肝脏组织,提取鼠肝DNA,针对
COI和Cytb基因进行PCR扩增并对产物进行测序。针对测序结果利用Mega7.0软件
进行遗传距离分析和系统进化分析:采用K2P模型分别计算COI基因样本和Cytb基
NeighborJoining,NJ
因样本的种内、种间遗传距离,采用邻接()法、最大似然
(MaximumLikelihood,ML)法分别构建COI基因样本和Cytb基因样本的系统发育
进化树。
结果:
1.吉林省对朝口岸地区平均鼠密度为4.36%。珲春口岸和长白口岸地区的鼠密度
显著高于其他两个口岸地区。在不同生境中,林地生境鼠密度显著高于农田生境和口
岸生活区生境的鼠密度,农田生境鼠密度显著高于口岸生活区生境的鼠密度。
2.吉林省对朝口岸地区共捕获鼠类490只,分别隶属于大仓鼠、大林姬鼠、褐家
鼠、黑线姬鼠、花鼠、小家鼠、长尾仓鼠、长爪沙鼠、棕背䶄9种。珲春、延吉、长
白口岸优势种群均为黑线姬鼠,通化口岸优势种群为褐家鼠。
3.吉林省对朝口岸地区中口岸生活区生境共捕获鼠类42只,优势种群为褐家鼠;
农田生境共捕获鼠类142只,优势种群为褐家鼠;林地生境共捕获鼠类306只,优势
种群为黑线姬鼠。
I
4.BLAST比对的结果为COI基因与参考序列的同源性在94.50%-100.00%,样本
Cytb基因与参考序列的同源性在99.07%-100.00%。基于COI基因的分子生物学鉴定
与形态学鉴定结果的一致率为90.00%,基于Cytb基因的分子生物学鉴定与形态学鉴
定结果的一致率为87.23%。使用同一样本同时进行基于COI和Cytb基因的分子生物
学鉴定,得出Cytb基因鉴定与形态学鉴定结果的一致率(83.83%),略高于COI基
因鉴定与形态学鉴定结果的一致率(61.61%)。
5.计算COI基因样本和Cytb基因样本各自与部分参考序列样本的种内、种间遗
7-10NJMLCOI
传距离的结果为种间距离大于种内距离的倍以上,用法、法分别构建
基因和Cytb基因的系统发育进化树的结果都显示为各个鼠种能单独分为一个分支,
从而能将不同属种的物种进行区分。结果中还包含了利用DNA条形码技术成功扩增
的3只残缺鼠类样本的COI基因序列和Cytb基因序列,计算种内、种间遗传距离和
构建进化树的结果也能根据不同属种的物种进行区分从而进一步确定残缺鼠类物种。
结论:
1.吉林省对朝口岸地区各口岸鼠密度均大于3%,其中珲春口岸和长白口岸地区的
鼠密度显著高于其他两个口岸地区。吉林省对朝口岸地区不同生境的鼠密度存在差别,
各生境的鼠密度由高到低依次为林地、农田、口岸生活区。吉林省对朝口岸地区优势
种为黑线姬鼠和褐家鼠。吉林省对朝口岸地区各生境的优势种主要为黑线姬鼠和褐家
鼠。
2.对鼠类样本的COI基因和Cytb基因进行BLAST序列比对、遗传距离分析及系
统发育分析能较为准确的进行物种的分类和鉴定,DNA条形码技术能够纠正形态学
鉴定的偏差,同时对残缺鼠类样本也能进行准确的分
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