凝胶成像及Quantity-One使用说明.doc

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GelDocTMXR

TheDiscoverySeriesQuantityOne?1-DAnalysisSoftware

使用说明书

昆明友宁科技

2008年9月

仪器各组成局部介绍

镜头及滤光片位控制面板紫外透射平台

镜头及滤光片位

控制面板

紫外透射平台

II控制面板

UniversalHood电源开关〔ChemiDoc另有镜头开关〕III反面开关及保险丝

UniversalHood电源开关〔ChemiDoc另有镜头开关〕

GelDoc镜头ChemiDoc镜头滤光片选择杆

GelDoc镜头

ChemiDoc镜头

滤光片选择杆

VUniversalHood内顶部

图像采集

用成像仪自带的荧光标尺和带刻度的透明塑料板,参照后文GelDocXR成像的方法,按紫外透射、白光透射以及侧面白光三种模式分别采集一次图像。要求成像清晰、明暗适中。

凝胶切割

将抽屉式紫外透射平台完全拉开至最大,将待切割的样品放置其上。安装上有机玻璃保护屏,翻开“TransUV”和“PrepUV”。操作者戴上手套,站在保护屏后进行切胶操作。

考前须知:

安装ChemiDocXRS的图像采集卡时,要先安装其驱动程序,再将图像采集卡插入;

如果软件的密码狗不能被正常识别,请安装带补丁的驱动程序或向Bio-Rad安装工程师求助;

在给用户安装图像仪和软件前,先提醒用户保存好申请来的密码、软件序列号和密码狗。

培训仪器时,提醒用户不要将潮湿的样品长期放在暗箱内,以防腐蚀滤光片,更不要将液体溅到暗箱底板上,以免烧坏主板。

提醒用户仪器用完,及时关上电源,特别是ChemiDocXRS的CCD电源;

提醒用户勿用控制成像仪的电脑上网,也不要自行重装电脑操作系统或给操作系统升级。

第二局部仪器及QuantityOne软件分析操作

简介

凝胶电泳是每个做分子生物学的研究者天天都要打交道的根本技术。电泳之后的信息处理与电泳本身同样重要。目前有大量软件可以用于分析电泳结果,今天要向大家介绍的是Bio-Rad公司的1D凝胶分析软件QuantityOne〔Bio-Rad还有一个做2D凝胶分析的软件PDQuest〕。QuantityOne软件是常用1D凝胶分析软件中功能最强大,自动化程度最高的软件。这个软件的必威体育精装版版本可以在Bio-Rad的网站〔://bio-rad〕免费下载,以供试用或用户升级之用。

QuantityOne软件的主要功能包括定量分析(VolumesQuickGuide),电泳条带分析(BandAnalysis),差显分析(DifferentialDisplayAnalysis),克隆计数(ColonyCountingAnalysis)等,此外,还可以直接控制Bio-Rad公司的各类图像仪和ExQuest自动切胶仪,使您的凝胶分析工作变得极为轻松。

QuantityOne软件拥有与windows操作系统下绝大多数应用软件相同的友好界面。

插入密码狗,翻开QuantityOne软件,可以看到最上缘蓝色横条幅是标题栏,往下依次是菜单栏和工具栏。

每个菜单的主要功能如下:

File

图像翻开、保存、引入、打印等操作

Match

分子量估算、条带匹配分析

Edit

图像普通编辑操作

Volumn

定量分析

View

图像缩放、三维视图、看光密度值等操作

Analysis

浓度估算、克隆计数等分析

Image

图像旋转、翻转、裁切等操作

Reports

分析结果输出

Lane

泳道分析

Window

窗口分析

Band

条带分析

Help

帮助、快捷菜单、软件注册等

往下一行是工具栏,上面每个按钮的功能见下表:

翻开文件

图像显示控制

条带分析工具

保存操作

显示条带

匹配工具

打印图像

去除分析标记

轮廓修改工具

看全图

图像工具

打印快捷指南

局部放大

文字工具

定量分析快捷指南

拖曳

定量工具

条带分析快捷指南

放大并居中

灰度分析工具

克隆计数快捷指南

缩小并居中

泳道分析工具

QuantityOne软件Help?QuickGuide快捷指南提示如何实现一个功能,如定量分析(VolumesQuickGuide),电泳条带分析(BandAnalysis),差显分析(DifferentialDisplayAnalysis),克隆计数(ColonyCountingAnalysis)等。快捷指南下有1,2,3…步骤,根据提示完成。

使用QuantityOne软件进行电泳结果分析,通常包括图像获取、图像优化、分析、结果输出四局部,参考下列图:图像获取就是通过软件控制扫描仪〔GS-800、PharosFX等〕或凝胶成像系统〔GelDoc、ChemiDoc

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