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(一)RNA提取所用器皿的处
理及溶液的准备
经高压灭菌的一次性使用的塑料制品如试管,离心管等基本上无RNase,可以不经预处理直接用于制备和贮存RNA,实验室用的普通玻璃器皿经常有RNase污染,使用前必须于180℃干烤8小时以上,或用0.1焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡用于制备RNA的烧杯,试管和其它用品。第30页,课件共85页,创作于2023年2月DEPC是RNase的强烈抑制剂。灌满DEPC的器皿于37℃下放置2小时,然后用灭菌水淋洗数次,并于100℃干烤15分钟,最后高压蒸汽下15分钟。上述处理可除去器皿上良量的DEPC,以防DEPC通过羧甲基化作用对RNA的嘌呤碱基进行修饰。第31页,课件共85页,创作于2023年2月要注意的是,DEPC有致癌性,操作时须小心。对于RNA提取所需溶液的配制,必须用高压灭菌的水和RNA研究专用的化学试剂配制溶液,用干烤过的药匙称取试剂,将溶液装入无RNase的玻璃器皿。第32页,课件共85页,创作于2023年2月可能的话,溶液均应用0.1%DEPC于37℃至少处理12小时,然后于100℃加热15分钟或高压蒸汽灭菌15分钟.须注意的是,DEPC可与胺类迅速发生化学反应,因此不能用来处理含有Tris一类的缓冲液,因此可存几瓶新的,未开封的Tris试剂以制备无RNase的溶液.第33页,课件共85页,创作于2023年2月(二)RNA提取中RNase污染的控制
实验操作人员的手是RNase污染最主要的潜在来源。因此,在准备用于RNA纯化的实验材料和溶液时,以及在涉及RNA的整个提取操作过程中,都应戴一次性手套。第34页,课件共85页,创作于2023年2月实验中,如触摸“脏的”玻璃器皿和其它物品以后手套就可能会沾染上RNase,因此在RNA提取实验中,应勤换手套。常用的RNase抑制剂有以下几种:第35页,课件共85页,创作于2023年2月1.RNase的蛋白质抑制剂这种RNase的蛋白质抑制剂是从人胎盘分离得到,可与多种RNase以非共价方式紧密结合,从而使RNase失活。其可置于含5mmol/L二硫苏糖醇(DTT)的50%甘油中,贮存于-20℃。第36页,课件共85页,创作于2023年2月2.钒核糖核苷复合物这种复合物由氧钒(IV)离子和4种核糖核苷之中的任一种所组成,能与多种RNase结合,并几乎能百分之百地抑制RNase的活性。第37页,课件共85页,创作于2023年2月3.硅藻土硅藻土是一种粘土,通过吸附RNase而去除其降解RNA的作用。第38页,课件共85页,创作于2023年2月(三)RNA提取方法
RNA提取的常用方法有:(1)表面活性剂加蛋白酶K,氯仿-酚抽提法;(2)胍盐提取结合氯仿-酚抽提法;(3)胍盐提取结合玻璃粉、二氧化硅等颗粒悬浮吸附法等。第39页,课件共85页,创作于2023年2月第一种方法所提取的RNA纯度高,反转录(RT)-PCR扩增的特异性好,缺点是操作繁琐,易造成微量标本的丢失或标本间的交叉污染,还易因RNA降解而影响测定结果的可靠性及敏感性;第40页,课件共85页,创作于2023年2月第三种方法较为方便省时,不需氯仿-酚抽提,但对玻璃粉、二氧化硅等的质量有要求;第二种方法虽较为复杂,但结果稳定性最优,因为使用强烈变性剂加盐酸胍或硫氰酸胍溶液能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破环而从核酸上解离下来。第41页,课件共85页,创作于2023年2月RNase可耐受多种处理(例如煮沸)而不失活,但却会被4mol/L硫氰酸胍和β-巯基乙醇等还原剂所灭活,因此可联用上述试剂从组织中提取完整无损的RNA。下面以血清(浆)的异硫氰酸胍(GuSCN)结合氯仿-酚说明RNA常用提取方法。第42页,课件共85页,创作于2023年2月异硫氰酸胍(GuSCN)结合氯仿-酚提取法异硫氰酸胍(GuSCN)结合氯仿-酚提取法第43页,课件共85页,创作于2023年2月(1)试剂
20%PEG6000
裂解液:
4mol/LGuSCN,
25mmol/L柠檬酸钠pH7.0,
0.5%Sarkosyl(十二烷基肌酸钠)
100mmol/Lβ-巯基乙醇
饱和酚:氯仿:异戊醇(50:49:1)3mol/LNaAcPH5.2
无水乙醇
75%乙醇
DEPC处理的无菌去离子水
RNasin(RNA酶抑制剂)第44页,课件共85页,创作于2023年2月(2)操作步骤
200μl血清(浆)
加入200μl20%PEG6000
4℃3小时,12000rpm离心15分钟(4℃),弃上清
加入500μl裂解液混匀
第45页
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