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Ⅰ型DHV分离株全基因组序列分析及嵌合病毒全长cDNA克隆的构建的开题报告

1.研究背景

禽呼吸道疾病（avianrespiratorydisease，ARD）是家禽养殖业界的一大难题。其中，禽呼吸道病毒（avianrespiratoryviruses，ARVs）是其中的主要致病因子之一，其中包括多种RNA病毒，包括滴状病毒（reovirus）、流行性感冒病毒（influenzavirus）、鸭瘟病病毒（duckviralenteritisvirus）。其中分离气管、支气管、肺和肺泡四种DHV（duckhepatitisvirus）类型分别为Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型，其中Ⅰ型DHV是最常见的一种。

Ⅰ型DHV主要感染鸭自然疫源区的耳眼鼻部黏膜上皮细胞，引起呼吸道症状，严重时可导致鸭的死亡。由于Ⅰ型DHV会引起严重的经济损失，因此对该病毒的研究和预防具有重要意义。

2.研究目的

本研究旨在通过分离Ⅰ型DHV分离株对其全基因组进行序列分析，并以此为基础克隆构建其嵌合病毒全长cDNA，为深入研究该病毒的基础研究和防治措施提供重要的参考。

3.研究内容

（1）采集鸭的气管、肺、肺泡等呼吸道组织，利用PCR和细胞培养技术，从鸭疫源区分离Ⅰ型DHV分离株；

（2）将分离株组装在测序文库中，对其进行全基因组测序；

（3）利用生物信息学手段分析Ⅰ型DHV分离株全基因组序列，包括GC含量、开放阅读框、启动子、转录因子结合位点和编码蛋白等信息；

（4）基于Ⅰ型DHV分离株全基因组序列克隆构建其嵌合病毒全长cDNA，并将其插入至质粒载体中；

（5）对构建的嵌合病毒全长cDNA进行鉴定和测序，确保其表达正确无误；

4.预期成果

完成本研究所述的分离、序列分析和嵌合病毒全长cDNA克隆构建等研究工作后，预期可以得到Ⅰ型DHV分离株的全基因组序列和嵌合病毒全长cDNA。并且可以通过灵敏度的检测手段，对其进行检测和分析，为深入研究Ⅰ型DHV的基础研究和防治措施提供重要的参考。