第十一章-微生物分类.ppt

第十一章微生物分类第一节分类单元一、微生物分类等级二、种的定义三、种以下的分类单元2、变种(Variety,var.)4、菌株(Strain)第二节微生物的命名方法第三节微生物的分类系统一、原核生物的分类系统二.真菌的分类系统三、细菌的分类鉴定（1）细菌鉴定的基本条件（2）细菌鉴定的检索表（3）细菌鉴定的原则（4）细菌鉴定的步骤具体的原则归纳起来主要有五点：①必须保证所鉴定的分离物始终是纯培养物。④根据文献资料逐步缩小分离物的归属范围到属、种。⑤尽量减少所使用的实验项目。②要有一个已知的、可靠的参考菌株作对照，以证明本实验室采取的实验条件是有效的。③试验的方法一般应用公认的或指定的，并严格按要求进行。细菌鉴定的步骤依鉴定的要求，以及所鉴定菌株归属类群的不同而有所不同。细菌鉴定的一般程序如下：①初步鉴定②全面鉴定③鉴定结果的判断①初步鉴定初步鉴定是为了掌握未知菌株的一些基本特征，然后，通过查阅有关的文献资料或细菌检索表，初步判断该菌株可能的归属范围(目、科、属等)，基本特征包括六个方面：a.基本形态：球状、杆状或螺旋状；有无特殊结构；革兰氏染色反应；有无运动性等。b.某些突出的培养特征：能否产生色素等。c.营养方式：是化能自养、化能异养或光合细菌，有无特殊的营养要求等。d.对氧气的要求：好氧、厌氧、微好氧或兼性。e.糖类的代谢方式：是发酵性的或氧化性的。f.其他：接触酶、氧化酶有无等。②全面鉴定在初步鉴定未知菌株可能属于某属的基础上，须进一步全面考察该菌株是否就是该属的细菌，或是该属的某个种。全面鉴定的实验项目主要参照文献资料上对该属和其中各种的特征描述，以及这些属、种与相关的属、种之间的鉴别性特征来确定。*学时：3教学内容1.了解分类的单元2.掌握微生物的命名方法3.了解微生物的分类系统4.了解微生物的分类鉴定方法微生物分类学通常由三个部分组成：分类(Classification)命名(Nomenclature)鉴定(Identification)微生物分类学微生物分类学(Microbialtaxonomy)是一门研究微生物分类的理论和方法的科学。1、分类(Classification)：根据细菌的相似性或亲缘关系，将细菌归并到不同的分类阶元中。2、鉴定(Identification)：确定一个新的分离物(菌株)是否属于已命名的分类阶元的过程。3、命名(Nomenclature)：根据国际命名法规，给予细菌一个科学的名称。一、微生物分类等级二、种的定义三、种以下的分类单元分类等级也叫分类单元，在微生物分类中，分类单位是按一定的阶元顺序排列的，自上而下依次可分为七个等级：界(Kingdom)门(Phylum)纲(Class)目(Order)科(Family)属(Genus)种(Species)亚种(Subspecies)种又称物种，是微生物分类学最基本的分类单位。关于种的概念争论较大，至今尚未形成一个统一的定义。一般可以认为：种是一个基本的分类单位，是一群表型特征高度相似、亲源关系极其相近、与同属内的其他种有着明显差异的菌株的总称。为了避免混乱，长期以来微生物分类多采用“模式”或“典型”的概念，如“模式种”、“典型菌株”等。为了使用方便，在种以下人们又提出了许多分类单元，这些分类单元不是正式的分类单位，一般也没有得到国际公认。1、亚种(Subspecies，subsp.,ssp.)在种内，根据少数几个稳定的变异特性或遗传性状区分为小群，这样可将一个种分为两个和更多的小的分类单位，称为亚种。亚种是微生物分类中具有正式分类地位的最低等级。亚种是在种的加词后写上“subsp.”、或“ssp.”，再写上亚种的加词。Bacilluscereussubsp.mycoides(Flügge)Smithetal.1946变种是亚种的同义词，因易引起混乱，1975《国际细菌命名法规》已取消其在命名法中的地位，且不主张使用。3、型(Form)是亚种以下的分类单位，是指具有相同或相似特性的一个或一组菌株构成的分类类群。常见的有生物型、形态型、血清型、病理型、噬菌体型等。菌株是指由任何一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其后代。一种微生物的每一不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一个菌株。菌株