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圆二色光谱分析法
引言
五十年代初,生物学研究从宏观领域深入到微观领域,开创了分子生物学的新时代。
随着研究的不断深入和发展,生物学已发展成最活跃的学科之一。
手性(Chirality)是物质结构中的重要特征.即具有不能重叠的三维镜像对映异构体,它
们的分子式完全相同,但其中原子或原子基团在空间的配置不同,互为镜像。凡手性分子
都具有光学活性,即可使偏振光的振动面发生旋转。生物基础分子一般都具有手性,也都
具有光学活性。在自然界中,氨基酸有L型和D型两种对映异构体,组成蛋白质的20种氨基
[1]
酸,除最简单的甘氨酸不具有手性外,其余都是L型的。
手性分子都具有光学活性。当单色左旋与右旋的圆偏振光通过某一种手性样品时,该
样品对左、右旋圆偏振光的吸收不同,这叫做圆二色性(CircularDichroism)。其差值
△A=△AL-△AR称为圆二色值,按波长扫描就得到了圆二色谱(CD谱)。
CD谱是特殊的吸收谱,它比一般的吸收谱弱几个量级,但由于它对分子结构
十分敏感,因此近十几年来,CD已成为研究分子构型(象)和分子间相互作用的最重要
的光谱实验之一。利用CD研究生物大分子和药物分子,具有重要的科学意义和实用价值
[2,3]
。
一、蛋白质的圆二色性
蛋白质是由氨基酸通过肽键连接而成的具有特定结构的生物大分子。蛋白质一般有一
级结构、二级结构、超二级结构、结构域、三级结构和四级结构几个结构层次[4-6]。在蛋
白质或多肽中,主要的光活性基团是肽链骨架中的肽键、芳香氨基酸残基及二硫桥键。当
平面圆偏振光通过这些光活性的生色基团时,光活性中心对平面圆偏振光中的左、右圆偏
振光的吸收不相同,产生的吸收差值,由于这种吸收差的存在,造成了偏振光矢量的振幅
差,圆偏振光变成了椭圆偏振光,这就是蛋白质的圆二色性。圆二色性的大小常用摩尔消
光系数差△(-1·cm-1)来度量。蛋白质的CD光谱一般分为两个波长范围,即178—250
nm为远紫外区CD光谱,250—320nm为近紫外区CD光谱,具有不同二级结构的蛋白质或
多肽所产生CD谱带的位置、吸收的强弱都不相同。近紫外CD光谱的测量与远紫外CD测量
相似,但近紫外CD光谱测量所需蛋白质溶液的浓度一般比远紫外CD测量高1~2个数量级,
其测量可在1cm的方形石英池中进行。
由于CD是一种定量的、灵敏的光谱技术。所以,样品的准备及测量条件的选择对分析
计算蛋白质构象的准确性至关重要,一般测试用的蛋白质样品中应避免含有光吸收的杂质,
缓冲剂和溶剂在配制溶液前最好做单独的检查,透明性极好的磷酸盐可用作为缓冲体系。
CD光谱的测量一般在蛋白质含量相对低(0.0l-0.2g/L)的稀溶液中进行,溶液最大的吸收不
超过2。稀溶液可减少蛋白质分子间的聚集。但如果太稀,则导致蛋白质过多地吸附在容器
壁上,影响实验的准确性。
二、远紫外CD分析蛋白质二级结构
远紫外CD分析蛋白质二级结构的方法,主要是运用计算机采用一定的拟合算法对CD
数据进行加工处理,进而解析蛋白质二级结构。远紫外区CD光谱主要反映肽键的圆二色性。
在蛋白质或多肽的规则二级结构中,肽键是高度有规律排列的,其排列的方向性决定了肽
键能级跃迁的分裂情况。单一波长常用于测定蛋白质或多肽由动力学或热力学引起的二级
结构的变化。α-螺旋结构在208及222nm有特征吸收峰,可以利用这两处的摩尔椭圆度
[7]
[θ]或[θ]来简单估计α-螺旋的含量。参考蛋白是拟合未知蛋白质远紫外CD二级结构
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的参考标准,参考蛋白的选取将影响CD拟合结果。
随着光学技术发展及同步加速器辐射圆二色(SRCD)光谱技术的发展,远紫外测量光谱
可以拓宽到190nm以下的真空远紫外区。由于这一CD光谱区域内,包含着更为丰富的蛋
白质二级结构信息,这一光谱区域的参考蛋白质的圆二色光谱及拟合运算方法也已成为研
究热点。
三、近紫外CD分析蛋白质三级结构
蛋白质中芳香氨基酸残基,如色氨酸(Trp)、酪氨酸(Tyr)、苯丙氨酸(Phe)及二硫键处
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