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不同毒力PRRSVs感染后肺组织的转录组与蛋白质组学初步研究的开题报告
背景:
猪繁殖与呼吸综合症病毒(PRRSV)是一种疫情严重的病毒,常出现猪只流产、咳嗽、发热等症状,给养殖业造成严重损失。PRRSV存在多种毒力,不同毒力PRRSV对宿主机体的影响也不同。因此,了解不同毒力PRRSV感染后猪肺组织的转录组和蛋白质组学变化,有助于进一步认识PRRSV对猪体的病理机制。
研究目的:
本研究旨在利用转录组和蛋白质组学方法,探究不同毒力PRRSV感染后肺组织的变化情况,挖掘差异表达基因和蛋白质,为深入研究PRRSV的致病机制提供参考。
研究方法:
1.实验动物:选取2个月龄的无特定病原体SPF级别的Landrace猪,随机分为3组,每组20头。分别接种低毒力PRRSV(LV)、高毒力PRRSV(HV)和对照。
2.样本收集:分别于接种后的1、3、5、7和14天收集肺组织样本。
3.转录组分析:利用RNA-seq技术对每个时间点的肺组织样本进行RNA测序,挖掘差异表达基因,并利用KEGG和GO数据库进行基因功能注释和通路分析。
4.蛋白质组学分析:利用二维凝胶电泳技术对每个时间点的肺组织样本进行蛋白质分离,确定差异表达蛋白质,并进行功能注释和通路分析。
研究意义:
本研究将通过RNA-seq和二维凝胶电泳技术,系统地探究PRRSV感染后猪肺组织的转录组和蛋白质组学变化,挖掘和鉴定不同毒力PRRSV引起的差异表达基因和蛋白质,并对其进行功能和通路分析,从而深入探究PRRSV的致病机制。这对于早期防控PRRSV感染,提高养殖效益,具有重要的理论和实践价值。
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