一种经济便捷的手足口病原RNA提取方法.pdf

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中国现代药物应用2010年11月第4卷第21期ChinJModDrugAppl,Nov2010,Vo1.4,No.21·8l·

一种经济便捷的手足口病原RNA提取方法

张畅斌尹爱华何天文王波邓文喻赖有行

【摘要】目的介绍运用二氧化硅微粒经济便捷提取手足口病原RNA的方法。方法手足口病

患儿临床标本107份(粪便89份,肛拭18份)分别以二氧化硅微粒法及QIAGEN试剂盒提取RNA,以实

时荧光RT.PCR检测肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV71)及柯萨奇病毒A组l6型(CoxA16)特异核

酸片段。结果88份(98.9%)粪便标本,17份肛拭(94.4%)肛拭标本运用二氧化硅微粒法提取的

RNA在手足口病原实时荧光RT。PCR检测中取得与QIAGEN试剂盒相一致的结果。结论二氧化硅微

粒法提取手足口病原RNA经济、便捷、有效,适合临床实验室应用于手足口病的诊断。

【关键词】手足口病;肠道病毒;核酸提取;RT—PCR;实时荧光RT—PCR

手足口病是由肠道病毒(enterovirus)引起的急性传染1.4.1二氧化硅微粒法

病,其中以柯萨奇病毒A组l6型(CoxA16)、肠道病毒71型1.4.1.1加适量0.9%氯化钠注射液(粪便标本:20倍体

(EV71)多见。近年该病在我国部分地区活跃流行并有死亡积;肛拭标本:1m]/拭子)震荡,悬液5000×g离心1min,吸

病例报告…,引起医疗卫生工作者的关注。实时荧光RT—上清100l于一个新管。

PCR¨2由于具有快速而敏感的特点,成为临床实验室诊断手1.4.1.2加入200Ixl裂解液,震荡混匀

足口病常用手段。实时荧光RT.PCR要求从标本中提取一1.4.1.3加入10LL1二氧化硅微粒悬液(注意吸取时确保悬

定浓度和纯度的病原RNA作为反应材料,目前较为普遍的液悬匀状态),震荡15s。

是使用各种商品试剂盒提取RNA。各种商品试剂盒提取1.4.1.46000×g离心(转速达6000×g后开始计时)10s,

RNA具有成本高、步骤繁琐的共同缺点。为了合理利用医疗弃上清,留沉淀

资源,提高效率,有必要寻找一个较为经济便捷,效果接近商1.4.1.5加入200l裂解液,震荡混匀,6000g离心(转

品试剂盒的病毒RNA提取方法。BOOM等报道的二氧化速达6000g后开始计时)10s,弃上清,留沉淀。

硅微粒提取核酸方法成本低廉、操作方便,对仪器设施要求1.4.1.6加入400l洗涤液,震荡混匀,如沉淀不能分散,

不高,是较有希望的候选方法。我们根据手足口病原的特点必须用移液器吸头吹打至悬匀。

对该法作进一步优化精简,并通过对比实验证明,该法与1.4.1.76000×g离心(转子速度达6000g后开始计时)

QIAGEN试剂盒所提取的RNA,在手足口病原实时RT-PCR10s,弃上清,敞开管盖,60℃加热5min,挥发干残留乙醇。

检测中,效果接近。下面作详细介绍。1.4.1.8加入30l预热至70℃的DEPC水,震荡混匀,如

1材料与方法沉淀不能分散,应该用移液器吸头吹打至悬匀,瞬时离心5s,

1.1标本来源2010年6月本院门诊及住院临床诊断为手上清液用于实时荧光RT—PCR检测。

足口病患儿发病7d内的粪便标本89份(年龄5个月一71.4.2使用QIAmpVimlRNAMiniKit严格按说明书操

岁,男50:女39),肛拭标本18份(年龄8个月一5岁,男:女作。在最后RNA洗出步骤时用421,zLAVE溶液过两次柱子,

=11:7)。收集RNA洗出液,直接用于实时荧光RT-PCR检测。

1.2主要仪器RocheLightCycler480荧光定量PCR仪。

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