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医学图像开源数据集汇总

编辑丨极市平台

极市导读

本文汇总了一些开源医学图像数据集，附下载链接。

3D-IRCADB脏器分割数据集

数据集链接：/6x5OSn

3D-IRCADb-01数据库由10名女性和10名男性75%的肝肿瘤

患者的3DCT扫描组成。20个文件夹对应20个不同的患者，可以单

独下载也可以联合下载。下表提供了图像信息，例如肝脏大小（宽度、

深度、高度）或根据Couninaud分割的肿瘤位置。它还表明肝脏分割

软件可能遇到的主要困难是由于与邻近器官的接触、肝脏的非典型形

状或密度，甚至图像中的伪影。

FASCICLE小腿肌肉超声数据集

数据集链接：/631rex

FAscicle小腿肌肉超声数据集是一个由812幅小腿肌肉超声图像

组成的数据集，用于分析肌肉弱点并预防受伤。该数据集在文章AW-

Net：B型超声图像上的自动肌肉结构分析以预防伤害中进行了介绍。

它结合了由RyanCunningham等人发表的两篇文章“使用卷积、残

差和反卷积神经网络从B模式超声图像中估计全区域骨骼肌纤维方向”

提供的数据集。和NeilCronin发表的“使用深度学习对肌肉骨骼超声

图像进行自动分析”，并附有补充注释。

该zip文件包含两个数据集，分别分为两个由其作者命名的文件

夹。每个数据集的每个图像都有一个匹配的分束分割掩码和一个可按

名称识别的腱膜分割掩码。

肿瘤数据集

数据集链接：/5zCyGj

这一数据集是通过仔细注释几名患有不同器官肿瘤并在多家医院

被诊断出的患者的组织图像获得的。该数据集是通过从TCGA存档下

载以40倍放大倍率捕获的HE染色组织图像创建的。HE染色是

增强组织切片对比度的常规方案，通常用于肿瘤评估（分级、分期

等）。考虑到多个器官和患者的细胞核外观的多样性，以及多家医院

采用的丰富染色方案，训练数据集将能够开发出开箱即用的稳健且可

推广的细胞核分割技术。

结直肠腺癌组织学图像数据集

数据集链接：/6axBLk

该数据集包含100张HE染色的结直肠腺癌组织学图像。出于

检测目的，在中心/周围共标记了29,756个原子核。其中，有22,444

个细胞核也具有相关的类别标签，即上皮细胞、炎症细胞、成纤维细

胞和其他细胞核。

淋巴结切片的组织病理学数据集

数据集链接：/6axBNq

本数据集由从淋巴结切片的组织病理学扫描中提取的327.680张

彩色图像(96x96px)组成。每个图像都带有一个二进制标签，表示存

在转移组织。PCam为机器学习模型提供了新的基准：大于CIFAR10，

小于imagenet，可在单个GPU上训练。

m2caiSeg腹腔镜图像数据集

数据集链接：/5yW8q0

m2caiSeg是根据真实世界外科手术的内窥镜视频源创建的。数据

由307张图像组成，每张图像都针对场景中存在的器官和不同的手术

器械进行了注释。