测序引物设计指南.docx

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测序引物设计指南

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PCR引物设计方法:

引物最好在模板cDNA的保守区内设计。

DNA序列的保守区是通过物种间相像序列的比较确定的。在NCBI上搜寻不同物种的同一基因,通过序列分析软件〔比方DNAman〕比对〔Alignment〕,各基因一样的序列就是该基因的保守区。

引物长度一般在15~30碱基之间。

引物长度〔primerlength〕常用的是18-27bp,但不应大于38,由于过长会导致其延长温度大于74℃,不适于TaqDNA聚合酶进展反响。

引物GC含量在40%~60%之间,Tm值最好接近72℃。

GC含量〔

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