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    Publishedonline16December2009NucleicAcidsResearch,2010,Vol.38,No.61767–1771

    doi:10.1093/nar/gkp1137

    SURVEYANDSUMMARY

    TheSangerFASTQfileformatforsequences

    withqualityscores,andtheSolexa/Illumina

    FASTQvariants

    1,234

    PeterJ.A.Cock*,ChristopherJ.Fields,NaohisaGoto,MichaelL.Heuerand

    PeterM.Rice5

    1PlantPathology,SCRI,Invergowrie,DundeeDD25DA,UK,2InstituteforGenomicBiology,1206W.Gregory

    Drive,M/C195,UniversityofIllinoisatUrbana-Champaign,IL61801,USA,3GenomeInformationResearch

    Center,ResearchInstituteforMicrobialDiseases,OsakaUniversity,3-1Yamadaoka,Suita,Osaka565-0871,

    Japan,4HarbingerPartners,Inc.,855VillageCenterDrive,Suite356,St.Paul,MN55127,USAand5EMBL

    Outstation-Hinxton,EuropeanBioinformaticsInstitute,WellcomeTrustGenomeCampus,Hinxton,

    CambridgeCB101SD,UK

    D

    o

    w

    ReceivedOctober13,2009;RevisedNovember13,2009;AcceptedNovember17,2009n

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