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第4讲多元统计分析
多元数据
2
多元数据基本方法
聚类(cluster)排序(ordination)
3
4
Doubs鱼类数据集
法国和瑞士边境的Jura山脉的Doubs河量名称代位
离源距离daskm
海拔Altma.s.l.
坡度pen‰
3-1
平均最小流量debms
pHpH-
度(硬度)durmgL-1
磷酸度phomgL-1
硝酸度nitmgL-1
度ammmgL-1
氧含量oxmgL-1
生物需氧量dbomgL-1
该数据集包括3个矩阵,第一个矩阵是27种鱼类在每个样方的多度,
第二个矩阵包括11个与河流的水文、地形和水体化学属性相关的环
5
境变量,第三个矩阵是样方的地理坐标(笛卡尔坐标系,X和Y)。
聚类分析
6
排序的对象-距离矩阵
距离(distance)(相异性)矩阵。
例如欧氏距离、Jaccard相似系数
8
基于连接的层次聚类
平均聚合聚类
9
#加载所需的程序包
library(ade4)
librar
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