多元统计分析-(4)-PPT课件.pdf

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第4讲多元统计分析

多元数据

2

多元数据基本方法

聚类(cluster)排序(ordination)

3

4

Doubs鱼类数据集

法国和瑞士边境的Jura山脉的Doubs河量名称代位

离源距离daskm

海拔Altma.s.l.

坡度pen‰

3-1

平均最小流量debms

pHpH-

度(硬度)durmgL-1

磷酸度phomgL-1

硝酸度nitmgL-1

度ammmgL-1

氧含量oxmgL-1

生物需氧量dbomgL-1

该数据集包括3个矩阵,第一个矩阵是27种鱼类在每个样方的多度,

第二个矩阵包括11个与河流的水文、地形和水体化学属性相关的环

5

境变量,第三个矩阵是样方的地理坐标(笛卡尔坐标系,X和Y)。

聚类分析

6

排序的对象-距离矩阵

距离(distance)(相异性)矩阵。

例如欧氏距离、Jaccard相似系数

8

基于连接的层次聚类

平均聚合聚类

9

#加载所需的程序包

library(ade4)

librar

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