(完整word版)生物大分子结构与功能重点总结.doc

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二十种氨基酸单字母缩写及分类。

以CDK2说明蛋白质柔性

这样大的集合性运动在X-射线晶体学研究中所表现出来的是电子密度的水平低,甚至在某些情况下看不到电子密度的存在。产生这样的运动的区域通常在晶体学中被表述为柔性(flexibility)运动或无序(disorder)。

cyclinA依赖型激酶CDK2有两个结构域,N-端结构域由一段α螺旋β折叠片组成,在α螺旋中PSTAIRE的氨基酸顺序(红色)在所有的CDKs蛋白激酶中都是高度保守的;C-端结构域主要由α螺旋组成,并含有一段柔性的环区域称作T-loop(黄色)环区域,含有一个苏氨酸残基,在完全活性的酶中该苏氨酸残基被磷酸化。

左图:在非活性态,PSTAIRE螺旋红色的取向使Glu51指向远离ATP的结合部位,而T-loop封住了与底物的结合部位,以阻止蛋白结合到CDK2上。

右图:在活性的cyclinA-CDK2复合物结构中,PSTAIRE螺旋发生了重新定向以使得Glu51残基指向活性部位并与另一个与催化有关的残基Lys33形成盐键,T-loop改变了构象并与另一个残基Asp145一起与活性部位中的镁离子配位,此时底物的结合部位被打开,蛋白可以结合底物。cyclin-CDK2复合物可以磷酸化Ser/Thr残基并进而激活所结合的蛋白。

MHC分子结构特征,其如何发挥功能。

PPIase的催化机制。

病毒的结构,假二对称的作用。

最简单的病毒中心是核酸(DNA或RNA),外面包被着1层有规律地排列的蛋白亚单位,称为衣壳。构成衣壳的形态亚单位称为壳粒,由核酸和衣壳蛋白所构成的粒子称为核衣壳。较复杂的病毒外边还有由脂质和糖蛋白构成包膜。核壳按壳粒的排列方式不同而分为3种模式:二十面体对称,如脊髓灰质炎病毒;螺旋对称,如烟草花叶病毒;复合对称,如T偶数噬菌体。

GPCR如何实现信号转导?

胞内部分有G蛋白结合区。G蛋白α,β,γ三种亚单位组成的三聚体,静息状态时与GDP结合.当受体激活时GDP-αβγ复合物在Mg2+参与下,结合的GDP与胞质中GTP交换,GTP-α与βγ分离并激活效应器蛋白,同时配体与受体分离。α亚单位本身具有GTP酶活性,促使GTP水解为GDP,在与βγ亚单位形成G蛋白三聚体恢复原来的静息状态。

略。

真核生物中特殊的转录花样。

原核与真核中结合DNA的蛋白花样的区别。

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