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森林图R语言代码
(含备注,附练习数据)
#代码
library(forestplot)
library(readr)
#从本地导入forest.csv数据,命名成mydata
格式的文件路径径例如:mydata-mydata-
#定义表头
of.of.
#增加一行
mydata-rbind(rep(NA,3),mydata)
#查看数据
View(mydata)
forestplot(labeltext=row_name,
#设置用于文本展示的列,此处我们用数据的前三列作为文本,在图中展示
zero=1,#设置参照值,此处我们展示的是OR值,故参照值是1
xlog=T,#对数x轴
xticks=c(0.5,1.0,2.0,4.0),#x轴刻度
boxsize=0.1,#设置点估计的方形大小
lineheight=unit(10,mm),#设置图形中的行距
colgap=unit(3,mm),#设置图形中的列间距
lwd.zero=2,#设置参考线的粗细
lwd.ci=1.5,#设置区间估计线的粗细
#使用fpColors()函数定义图形元素的颜色,从左至右分别对应点估计方形,汇总
值,区间估计线,参考线
设置x轴标签
lwd.xaxis=2,#设置x轴粗细
graph.pos=3,#设置森林图的位置,此处设置为3,则出现在第三列
is.summary=c(T,F,T,F,F,T,F,F,T,F,F))#该参数接受一个逻辑向量,用于定义数据中
的每一行是否汇总值,若是,则在对应位置设置TRUE,若否,则设置为FALSE,
设置为TRUE的行则以粗体出现
library(ggplot2)
forestplot(labeltext=row_name,
zero=1,
xlog=F,
xticks=c(0.5,1.0,2.0,4.0),
boxsize=0.1,
lineheight=unit(10,mm),
colgap=unit(3,mm),
lwd.zero=2,
lwd.ci=1.5,
lwd.xaxis=2,
graph.pos=3,
坐标轴
轴
is.summary=c(T,F,T,F,F,T,F,F,T,F,F))
附件:练习数据
SubgroupsNo.ofpatientsOR(95%CI)ORLLUL
总人群15631.79(1.41,2.28)1.791.412.28
性别
男性7691.81(1.36,2.39)1.811.362.39
女性7941.79(1.18,2.79)1.791.182.79
年龄分组
老年人10561.86(1.43,2.42)1.861.432.42
青年人5071.71(0.63,5.17)
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