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第一章蛋白质结构与功能
一.名词解释
1.模体:在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,称为模体。
2.结构域:在蛋白质的三级结构中,多肽链上相邻的超二级结构紧密联系,形成一个或多个有各自独特功能的区域。
3.蛋白质的变性:在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,称为蛋白质的变性。
4.分子伴侣:是提供一个保护环境,加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构的物质。
二.问答题
1.蛋白质元素组成的特点是什么?怎样根据蛋白质元素组成的特点计算生物样品中蛋白质的含量?
答:Pr元素组成主要有C、O、H、N和S,各种蛋白质含氮量平均为16%
每克样品含氮克数×6.25×100=100克样品中蛋白质含量〔g%〕
2.组成蛋白质的氨基酸结构上有何特点?酸性、碱性氨基酸有哪些?酸性氨基酸组成的蛋白质,碱性氨基酸组成的蛋白质在pH7.0时各带何种电荷?向电场中移动什么方向?
答:①组成人体蛋白质的氨基酸有20种,均属L-α-氨基酸〔除甘氨酸外〕
②酸性氨基酸:天冬氨酸和谷氨酸
碱性氨基酸:赖氨酸、精氨酸和组氨酸
③酸性氨基酸——带负电荷,向正极移动
碱性氨基酸——带正电荷,向负极移动
3.找出哪些是编码氨基酸,修饰氨基酸和游离非标准氨基酸?哪些参与蛋白质合成?色氨酸、蛋氨酸、羟脯氨酸、组氨酸、鸟氨酸、羟赖氨酸、半胱氨酸、胱氨酸、同型半胱氨酸、酪氨酸、精氨酸,这些氨基酸有哪些在280nm有紫外吸收作用?
答:编码氨基酸:色氨酸、蛋氨酸、组氨酸、半胱氨酸、酪氨酸、精氨酸
修饰氨基酸:羟脯氨酸、羟赖氨酸、胱氨酸
游离非标准氨基酸:鸟氨酸、同型半胱氨酸
参与蛋白质合成的氨基酸:色氨酸、蛋氨酸、羟脯氨酸、组氨酸、羟赖氨酸、半胱氨酸、胱氨酸、酪氨酸、精氨酸。
OD280nm处有紫外吸收作用的氨基酸:色氨酸和酪氨酸
4.蛋白质的结构有哪些?维持蛋白质各级结构的化学键有哪些?其中主要键是什么?
答:蛋白质的结构有一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。
一级结构是指多肽链中氨基酸的排列顺序。
二级结构是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构。即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
三级结构是指是指多肽链中所有原子在空间的整体排布,称为三级结构。
四级结构是指两条或两条以上独立具有三级结构的多肽链之间通过非共价键相互缔合而形成的聚合体。
一级结构的维持化学键是肽键和二硫键,其中肽键是主要化学键。
二级结构的维持化学键是氢键。
三级结构的维持化学键是疏水键、离子键、氢键和范德华力。主要是疏水键。
四级结构的维持化学键是氢键和离子键、疏水键、范德华力。主要是疏水键。
5.二级结构有哪些类型?α-螺旋、?-折叠结构有什么特点?
答:蛋白质的结构形式有四种类型:α-螺旋、?-折叠、?-转角、不规那么卷曲。
α-螺旋的特点:①右手螺旋②氨基酸侧链伸向螺旋外侧③每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈,螺距为0.54nm④α-螺旋的每个肽链的N-H和第四个肽链的羰基氧形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴根本平行。
?-折叠的特点:①呈锯齿状②R侧链伸出在主链的上或下方③链间氢键/两条链,一条肽,两段肽链④两条肽链方向:平行或反平行
6.变性蛋白质的特点有哪些?
答:空间结构破坏〔即次级键断裂〕;一级结构存在〔肽链存在〕;蛋白质变性后理化性质改变:如溶解度降低,黏度增加,结晶能力消失,生物活性丧失等;易被蛋白酶水解。
7.蛋白质在溶液中稳定存在的条件是什么?
答:蛋白质外表的同性电荷和水化膜是蛋白质在溶液中稳定存在的条件。
8.蛋白质的沉淀方法和原理是什么?沉淀与蛋白质变性有何关系?
答:蛋白质沉淀的方法:盐析法、有机溶液沉淀法、生物碱试剂沉淀法、重金属盐沉淀法。
蛋白质沉淀的根本原理是:中和电荷和脱水。
蛋白质的沉淀与变性的关系:变性的蛋白质易于沉淀,取决于变性的蛋白质存在的状态,但沉淀的蛋白质不一定变性,取决于沉淀的方法。
9.常见的蛋白质颜色反响方法有哪些?其原理是什么?
答:常见的蛋白质的颜色反响有:
茚三酮反响:蛋白质分子中如存在游离的α-NH2,可以与茚三酮溶液反响生成蓝紫色化合物。Pr-Cα-NH(Pro)→呈黄色。
双缩脲反响:在碱性溶液中含两个以上肽键的化合物都能与稀硫酸铜溶液反响呈紫红色。
酚试剂反响:Pr-(Tyr、Trp)与酚试剂反响呈钼蓝色。
10.蛋白质的别离提纯有哪些方法?
答:①透析及超滤法②丙酮沉淀、盐析及免疫沉淀③电泳④层析⑤超速离心等。
第二章核酸的结构与功能
一.名词解释
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