蛋白质组学技术及其在低剂量辐射生物效应中的应用课件.ppt

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;主要内容;;;人类基因组以及多种模式生物、重要生物基因组全

序列的完成,标志着生命科学研究进入所谓的“后基因

组时代(Postgenomeera)〞,即产生了功能基因组学

〔FunctionalGenomics〕;转录组学

蛋白质组学

代谢组学

表型组学

相互作用组

……;;蛋白质组与基因组相对应,也是一个整体的概念,是基因组表达的全部蛋白。但两者又有根本的不同之处

基因组是静态的,一个有机体从它的发生、开展到衰老、死亡,不同细胞、组织和器官的基因组是根本稳定不变。蛋白质组作为基因组表达的产物随时间、地点、环境等条件变化,是一个动态的概念。

在人类基因组方案中大约有30,000个基因被鉴定出来。一个基因=平均4个左右的剪接变异体,约120,000或更多的独立蛋白。翻译后修饰和蛋白相互作用,蛋白质组比基因组复杂10倍以上。;Proteomics;人类蛋白质组正式启动;蛋白质组学的研究内容;;;;FirstDimensionIEF;凝胶的图像处理分析和胶内酶切;图像扫描和分析——ImageScannerII;全自动斑点切取系统〔EttanSpotPicker〕

;;;;串联质谱序列分析;;;蛋白序列数据库

SWISS-PROT/TrEMBL;〕

基因序列数据库

Genbank,

EMBL,〕

蛋白模式数据库

Prosite;〕

蛋白质二维凝胶电泳数据库、蛋白三维结构数据库

PDB,;

FSSP,〕

蛋白翻译后修饰数据库

OGLYCBASE,

OGLYCBASE〕;;转录激活因子

转录激活因子在结构上是组件式的(modular),即这些因子往往由两个或两个以上相互独立的结构域构成,其中有DNA结合结构域(DNAbindingdomain,简称为DB)和转录激活结构域(activationdomain,简称为AD),它们是转录激活因子发挥功能所必需的。

单独的DB虽然能和启动子结合,但是不能激活转录。;报告基因;双杂交的原理

两个等测蛋白质1和2,前者与酵母菌转录激活因子Gal4的DB结合,另一个与Gal4的AD结合。;HIS基因表达;;;早期抑制糖分解及丙酮酸脱氢酶

晚期影响脂代谢,促进炎症反响;小鼠

出生第十天

七个月后处死

主要涉及通路:代谢、炎症反响和细胞骨架通路;蛋白质组学实验室所需的条件;Thankyou!

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