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基于k-近邻算法的分枝杆菌蛋白质亚细胞定位预测
摘要:分枝杆菌蛋白质亚细胞定位预测对于相关药物的研究有重要意义。本文从三个亚细胞中选取了200条蛋白质序列,采用氨基酸组分、二肽组分、NSBH特征方法及特征融合法作为特征参数来表征分枝杆菌的蛋白质序列,构建特征子集,运用K-近邻算法对分枝杆菌蛋白质进行亚细胞定位预测,详细说明了KNN算法的操作步骤,选取180条序列作为训练集,再选取三个亚细胞中总数的各10%的序列作为测试集,分析比较取不同的K值、提取不同特征及选不同的距离度量对预测结果的影响。实验结果表明,特征融合法的整体预测准确率比其余三
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