核酸测定波长含义.docx

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1. A260nm

核酸测定各波长具体含义及相关问题

是核酸最高吸收峰的吸收波长,最佳测量值的范围为0.1至1.0。如果不在此范围,稀释或浓缩样品,使之在此范围内;如果吸光度小于0.05,检查是否存在操作因素(如移液不准确,样品内有悬浮物等)影响。DNA样品的A260吸光度值是否0.1。(请注意,这个值跟仪器无关,核酸的吸光度必需大于0.1,其值才有效和可靠,因为样品中的杂质和颗粒这些不纯物的干扰通常会对光有一定吸收,其值0.1)

2.A280nm,A270nm

是蛋白最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA的A260/A280比值为1.8,纯RNA为2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚类物质的污染,需要纯化样品。比值=1.5相当于50%蛋白质/DNA溶液.酚的最大吸收峰在270nm。

A230nm

是碳水化合物最高吸收峰的吸收波长,比值可进行核酸样品纯度评估:纯DNA和RNA的A260/A230比值为2.5。若比值小于2.0标明样品被碳水化合物(糖类)、盐类或有机溶剂污染,需要纯化样品。A230产生负值主要是由于在很低DNA浓度的溶液中的一些其他成分的干扰所导致的。在下一个测定中,需要降低样品的稀释度,A230的负值会被校正。

A320nm或A340nm

为检测溶液样品的浊度和其他干扰因子。该值应该接近0.0。如果不是,标明溶液中有悬浮物,需要纯化样品。纯样品的A320一般是0。

5.A260/A280和A260/A230

是核酸纯度的指示值。纯度好的DNA或RNA,在pH7-8.5下A260/A280的比值应该在2.0或2.5。纯净的样品比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低于1.8或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物、盐(胍盐)等,较纯净的核酸A260/A230的比值大于2.0。

当0.5%BSA蛋白质污染时,蛋白污染会导致260和280的数值都下降,其净结果是260/280比值下降,但260/280的比值变化并不显著,正如分子克隆3所说。但蛋白残留会导致230的数值显著上升,显著影响260/230的比值。也就是说,如果RNA样品的260/280=1.7,260/230=0.5,那么就应该考虑污染原因不是胍盐残留,而是蛋白残留.

酚的最大吸收峰在270。酚的残留会显著的增加230、260和280的数值,同时酚的吸收峰与核酸的吸收峰合并后,最大吸收峰向270方向偏移,也就是说最大吸收峰在270附近。也就是说,如果RNA样品的260/280=1~1.5,260/230=1~1.5,那么污染原因就应该考虑是酚残留。

胍盐对RNA样品吸收有显著影响,会在小于230nm处产生大的吸收峰。胍盐残留不会影响260和280的数值,对260/280的比值不会造成大的影响,当然也不影响RNA定量。但胍盐残留对260/230比值具有明显影响。例如本例中260/230的比值小于0.21时,260/280的比值还2。也就是说,如果RNA样品的260/280=2,260/2301,那么污染原因就应该考虑是胍盐残留。

其他:

用分光光度计测量RNA时,用水而不是用TE缓冲液稀释RNA样品会造成A260/A280比值下降。原因是低离子强度和低pH溶液会增加280nm处的光吸收值。

加氯仿离心后取上清的时候千万不要贪多,那样就很容易被蛋白污染,所以现在一般取400ul左右。当260/2301时,只有两种情况。一是胍盐污染,二是蛋白污染。

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