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贝瑞深度解读：国内首个低深度全基因组测序技术专家共识

精准医学前沿

近年来高通量测序技术蓬勃发展，基于高通量测序的低深度全基

因组测序(copynumbervariationsequencing，CNV-seq)技术在产

前诊断中的应用逐步深入。

为此，中华医学会医学遗传学分会临床遗传学组、中国医师协会

医学遗传医师分会遗传病产前诊断专业委员会、中华预防医学会出生

缺陷预防与控制专业委员会遗传病防控学组共同成立专家组，探讨

CNV-seq技术在产前诊断中的应用规范。2019年4月10日，《低深

度全基因组测序技术在产前诊断中的应用专家共识》（以下简称“共

识”）在《中华医学遗传学》杂志上刊发。本公众号后台回复

获得该专家共识原文。

《共识》指出CNV-seq可以作为一线产前诊断技术对可能存在胎

儿染色体异常的孕妇进行产前诊断；《共识》的达成，有利于规范

CNV-seq技术的临床应用，使其更好地服务于临床。

本共识大致可分为七部分：前言、适用范围、局限性、临床应用

路线、检测前遗传咨询、检测后遗传咨询、规范化临床应用。现针对

其中的一些要点进行解读说明。

前言

二胎政策放开后，高龄孕妇的产前诊断需求日益增长。CNV-seq

技术高通量、低成本的特点，可以解决现阶段产前诊断服务供给严重

不足的矛盾。

在低比例嵌合体的有效检测方面，现行产前诊断技术（核型分析

和芯片检测）存在不足。核型分析需要细胞培养，而在培养过程中，

如果发生染色体畸变细胞的增殖速度落后于正常细胞，则检测结果可

能会漏掉低比例嵌合体。

CMA虽然无需细胞培养，但受限于荧光信号强度波动以及背景噪

音的影响，并不能准确分析＜30%的嵌合体。

CNV-seq技术无需细胞培养，测序完成后，通过计数每条染色体

拷贝数的细微改变，来精确判断嵌合体比例，故CNV-seq可以实现对

低比例嵌合体更好的检测，可为临床医生提供更为准确可靠的产前诊

断结果。

适用范围

共识原文（部分）：

染色体病高风险胎儿，如产前筛查高风险（包括血清学产前筛查、

NIPS、超声产前筛查等）、高龄、产前超声检查发现胎儿结构及生长

发育异常等，在孕妇充分知情的情况下，CNV-seq可以作为一线产前

诊断方法供其选择。

要点解读：

受限于现行产前诊断技术的不足，很多需要进行产前诊断的人群

（比如高龄、产前筛查高风险）无法得到产前诊断。很多医院仅对超

声结构异常的孕妇进行产前诊断，因此存在很大的漏诊风险。

CNV-seq技术很好的弥补了核型分析与芯片检测的不足，因此对

于染色体病高风险胎儿，CNV-seq技术可作为一线诊断方法供其选择。

在2018年5月份，AJOG发表了CNV-seq前瞻性临床研究数据，对

接受产前诊断且无CNV异常高风险（如胎儿超声检查提示结构异常等）

的3429例羊水样本进行CNV-seq分析。与核型分析相比，该技术可

额外检出1%的明确致病性CNV。该篇文章首次提出CNV-seq可以作

为一线诊断技术应用于产前诊断经验。

[1]

局限性

共识原文（部分）：CNV-seq无法检测异倍体、杂合性缺失（含

UPD）。

要点解读：

CNV-seq亦存在一定的局限性，如无法检测异倍体和杂合性缺失

（含UPD），但通过联合STR可实现对异倍体和部分杂合性缺失的分

析。此外，CNV-seq无法检测单基因病，WES技术可对单基因疾病进

行分析。

临床应用路线

原文内容（部分）：

CNV-seq实验操作主要分为三步：（1）样本基因组DNA提取；

（2）文库构建；（3）上机测序。其中，文库构建可以选择PCR