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锌指结构的药物靶标确证
IdentificationofLabileZnSitesinDrug-TargetProteins
锌指是一些由较短的多肽片段(少于50个氨基酸残基长度)形成的结构域,。但这些多肽片
段不能自身折叠成稳定的结构域。锌离子在一定条件下可以不需要任何化学反应就能与这种结
构形成稳定性结合,故它非常适于结合在这种由短片段多肽形成的结构中以维持其稳定,发
挥其特殊功能。锌指结构的稳定性由锌离子提供的链间交叉链连,如果缺乏锌离子则不能形
成蛋白质的折叠结构。这种ZFS的小的蛋白结构,在人类组编码中大量存在(约3%)。它
们的功能是作为交互作用模块连接,RNA,蛋白质,或脂质,在许多重要的细胞进程
中也是必需的,如转录,翻译,和修复,代谢,细胞增殖,细胞凋亡,信号转
导。
因而,可将锌指结构做为靶标,特异性逐出其中的锌离子,就可以使原有的功能改变。
在该中,研究的锌指结构有以下特点:1.锌键合硫醇结构,2.有Cys4orCys3His内核,
3.Zn-Cys不含氢键,具有此特性的锌指结构不稳定,锌离子可以被Zn-ejectionagents喷射出
去,使原结构改变,蛋白质失活。
:蛋白中的不稳定锌指结构中包含锌键合硫醇结构,它能与亲电试剂反应,锌离子
的喷射和蛋白质展开(变性)。这种活性锌指结构已被证明有Cys4orCys3His内核,其中锌
键合半胱氨酸中不含氢键。本文目的在于确证labileZfs的这种特性可以成为药物靶标。为
了证明,我们展示了5种含有该活性Zfs的蛋白质与锌喷射剂的反应,另有5种蛋白同样进
行反应但不含活性Zfs或含有惰性Zfs。一套广泛全面的labileZfs提供了新的药物靶点,同
时可以特异性的指导改进设计锌喷射化合物。
举例说明
ZF蛋白的结构与功能丧失,但对人类不起作用。这就是该靶标在抗逆转录药物中的作用。
2.不稳定的ZFS也已在疱疹中发现。
3.在人类雌激素受体(hER)中有labileZn•Cys4core的结合结构域,这是生长
所必需的。锌喷射剂能选择性地阻断了hER和结合和随后的转录。
4.JMJD2A中的labileZn•Cys3Hiscore,是治疗癌,,癌和胰的靶
标,亲电试剂可以弹出Zn•Cys3Hiscore中的Zn2+,从而抑制JMJD2A。。:
机理
分析早期的92种蛋白结构中的207种Zf结构域,表明骨架中NH•••S氢键决定Zn-bound
thiolate的活性。对Zn复合物的实验和理论研究都证实,骨架中的NH基团和Zn-bound
thiolate形成的单一氢键可以显著的降低其反应活性。再评价多种氨基酸类型的锌指结构中
Zn-boundthiolate甲基化和分离的自由能,确定Zn•Cys4,Zn•Cys3His与硫原子无相互作用。
所以最终在PDB中筛选靶标的条件:LabileZnsitesareCys4orCys3HiscorescontainingZn-
boundcysteinesthatarelikelytohavenohydrogen-bondinginteractions.
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