核酸提取方法的技术要点和注意事项.pdf

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核酸提取方法的技术要点和注意事项

一、核酸的基本概念核酸是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)

的总称,是由许多核苷酸单体聚合成的生物大分子化合物,为生命的

最基本物质之一。一个核苷酸分子是由一分子含氮的碱基、一分子五

碳糖和一分子磷酸组成的。根据五碳糖的不同可以将核酸分为脱氧核

糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两大类。

核酸都是极性化合物,都溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有机溶剂。在

酸性溶液中易水解,在中性及弱碱性溶液中稳定性稍高。

二、核酸提取前样本采集、预处理和保存全血:抗凝剂EDTA或枸橼

酸钠,不宜使用肝素

(抑制Taq活性);血清和血浆:主要用于检测病毒、细菌和肿瘤细

胞等释放入血的游离核酸;分泌物:痰液是检测呼吸道病原体核酸的

主要样本,深部咳痰,患者采集早晨起床后的第一口痰,采集前应先

漱口,以避免混入大量口腔脱落的上皮细胞和唾液影响检测结果。

三、核酸提取的基本步骤及使用试剂

1.核酸的释放;2.核酸的分离与纯化;3.核酸的浓缩、沉淀与洗涤。

核酸提取的常用组分

成分名称原理及作用

酚蛋白质的变性剂,可抑制DNase的降解作用

SDS(十二烷基磺亲水基表面活性剂,可破坏细胞膜、核膜、并

使组织蛋白酸钠)与DNA分离溶解脂类蛋白

TritonX-100非离子表面活性剂,有助于蛋白质与DNA分离

异硫氰酸胍变性裂解细胞,强有力的蛋白质变性剂,能迅速

溶解蛋白质,导致细胞结构破坏

4-羟乙基哌嗪一种重要的氢离子缓冲剂,能较长时间控制恒定

乙的pH

磺酸(HEPES)

异丙醇

DNA在冷乙醇或异丙醇中沉淀,因为DNA在醇中

不可溶而黏在一起,这一步也能除掉盐分

氯化钠

氯化钠溶液中DNA的溶解度最低,而蛋白质高,

可以去除蛋白;抑制核酸酶在裂解过程中对核酸

的破坏,维持核酸的稳定等

矿物油去除非核酸有机杂质

磁珠吸附核酸

四、实验室常用核酸提取技术

1.酚/氯仿抽提法/醇沉淀法;2.层析柱法;3.煮沸裂解法;4.一步

法;5.纳米磁珠法。

1.酚/氯仿抽提法/醇沉淀法:酚是蛋白质的变性剂,同时抑制了

DNase的降解作用,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶

K、EDTA的存在下消化蛋白质,核蛋白变性降解,使核酸释放。核酸

易溶于水,不溶于有机溶剂,蛋白质本身带有亲水基团,但当有机溶

剂存在时,蛋白质变性沉淀。利用离心后有机溶剂位于底层(脂质),

核酸存在水相层,蛋白质则沉淀于两相之间的原理分离核酸。

2.层析柱法:提DNA时:通过特殊硅基质吸附材料,能够特定吸附

DNA,而RNA和蛋白质顺利通过,然后利用高盐低PH结合核酸,低盐

高PH值洗脱,来分离纯化DNA。提RNA时:提取使用到的离心管壁多

是聚丙烯的材料,管壁上有静电,会吸附核酸。carrierRNA减少了目

标核酸物质的管壁吸附损失,进而提高微量的核酸纯化柱上的结合和

洗脱效率,同时降低了提取环境中的RNase降解微量RNA的概率。注

意:可以进行核酸的纯化核浓缩,不适用大批量样本,对人员操作要

求高。

3.煮沸裂解法:加入Tris等使细胞膜破裂,在用高温使细胞完全裂

解,并使宿主细胞的蛋白质与DNA变性,再使用有机溶剂抽提使

核酸分离并进行沉淀。通过离心去除变性的蛋白质和染色体DNA,

回收上清液中的目的DNA。注意:需要金属浴,有爆盖风险,不能

用于RNA。

4.一步法:首先核酸释放剂快速裂解、释放病毒核酸,然后加入待

测样本,与释放剂充分混匀,静置一段时间后,加入扩增试剂上

机扩增。注意:要求试剂盒的抗干扰能力高。

5.纳米磁珠法:磁珠表面连接了可特异地与核酸发生作用的功能基

团,具有可逆吸附核酸的特性,通常采用带有氨基、巯基、环氧

基等基团的活化试剂对磁珠表面包覆的高分子进行化学修饰。也

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