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核酸提取方法的技术要点和注意事项
一、核酸的基本概念核酸是脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)
的总称,是由许多核苷酸单体聚合成的生物大分子化合物,为生命的
最基本物质之一。一个核苷酸分子是由一分子含氮的碱基、一分子五
碳糖和一分子磷酸组成的。根据五碳糖的不同可以将核酸分为脱氧核
糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)两大类。
核酸都是极性化合物,都溶于水,不溶于乙醇,氯仿等有机溶剂。在
酸性溶液中易水解,在中性及弱碱性溶液中稳定性稍高。
二、核酸提取前样本采集、预处理和保存全血:抗凝剂EDTA或枸橼
酸钠,不宜使用肝素
(抑制Taq活性);血清和血浆:主要用于检测病毒、细菌和肿瘤细
胞等释放入血的游离核酸;分泌物:痰液是检测呼吸道病原体核酸的
主要样本,深部咳痰,患者采集早晨起床后的第一口痰,采集前应先
漱口,以避免混入大量口腔脱落的上皮细胞和唾液影响检测结果。
三、核酸提取的基本步骤及使用试剂
1.核酸的释放;2.核酸的分离与纯化;3.核酸的浓缩、沉淀与洗涤。
核酸提取的常用组分
成分名称原理及作用
酚蛋白质的变性剂,可抑制DNase的降解作用
SDS(十二烷基磺亲水基表面活性剂,可破坏细胞膜、核膜、并
使组织蛋白酸钠)与DNA分离溶解脂类蛋白
TritonX-100非离子表面活性剂,有助于蛋白质与DNA分离
异硫氰酸胍变性裂解细胞,强有力的蛋白质变性剂,能迅速
溶解蛋白质,导致细胞结构破坏
4-羟乙基哌嗪一种重要的氢离子缓冲剂,能较长时间控制恒定
乙的pH
磺酸(HEPES)
异丙醇
DNA在冷乙醇或异丙醇中沉淀,因为DNA在醇中
不可溶而黏在一起,这一步也能除掉盐分
氯化钠
氯化钠溶液中DNA的溶解度最低,而蛋白质高,
可以去除蛋白;抑制核酸酶在裂解过程中对核酸
的破坏,维持核酸的稳定等
矿物油去除非核酸有机杂质
磁珠吸附核酸
四、实验室常用核酸提取技术
1.酚/氯仿抽提法/醇沉淀法;2.层析柱法;3.煮沸裂解法;4.一步
法;5.纳米磁珠法。
1.酚/氯仿抽提法/醇沉淀法:酚是蛋白质的变性剂,同时抑制了
DNase的降解作用,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶
K、EDTA的存在下消化蛋白质,核蛋白变性降解,使核酸释放。核酸
易溶于水,不溶于有机溶剂,蛋白质本身带有亲水基团,但当有机溶
剂存在时,蛋白质变性沉淀。利用离心后有机溶剂位于底层(脂质),
核酸存在水相层,蛋白质则沉淀于两相之间的原理分离核酸。
2.层析柱法:提DNA时:通过特殊硅基质吸附材料,能够特定吸附
DNA,而RNA和蛋白质顺利通过,然后利用高盐低PH结合核酸,低盐
高PH值洗脱,来分离纯化DNA。提RNA时:提取使用到的离心管壁多
是聚丙烯的材料,管壁上有静电,会吸附核酸。carrierRNA减少了目
标核酸物质的管壁吸附损失,进而提高微量的核酸纯化柱上的结合和
洗脱效率,同时降低了提取环境中的RNase降解微量RNA的概率。注
意:可以进行核酸的纯化核浓缩,不适用大批量样本,对人员操作要
求高。
3.煮沸裂解法:加入Tris等使细胞膜破裂,在用高温使细胞完全裂
解,并使宿主细胞的蛋白质与DNA变性,再使用有机溶剂抽提使
核酸分离并进行沉淀。通过离心去除变性的蛋白质和染色体DNA,
回收上清液中的目的DNA。注意:需要金属浴,有爆盖风险,不能
用于RNA。
4.一步法:首先核酸释放剂快速裂解、释放病毒核酸,然后加入待
测样本,与释放剂充分混匀,静置一段时间后,加入扩增试剂上
机扩增。注意:要求试剂盒的抗干扰能力高。
5.纳米磁珠法:磁珠表面连接了可特异地与核酸发生作用的功能基
团,具有可逆吸附核酸的特性,通常采用带有氨基、巯基、环氧
基等基团的活化试剂对磁珠表面包覆的高分子进行化学修饰。也
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