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计算生物化学课程教学大纲

计算生物化学课程教学大纲

计算生物化学课程教学大纲全文共1页，当前为第1页。CourseOutline

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课程基本信息（CourseInformation）

课程代码

（CourseCode）

BI472

学时

（CreditHours）

48

学分

（Credits）

3.0

课程名称

（CourseName）

计算生物化学

ComputationalBiochemistry

课程性质

(CourseType)

培养计划课程

授课对象

（TargetAudience）

授课语言

(LanguageofInstruction)

中外双语，所有栏目皆须有中外文版本

开课院系

（School）

生命学院

先修课程

（Prerequisite）

《生物化学》

授课教师

（Teacher）

赵一雷、石婷

课程网址

(CourseWebpage)

*课程简介（Description）

（中文版，含概括描述课程目标）

作为计算生物学的专业课，《计算生物化学》强调生物化学分子机理研究的基础理论和计算方法。课程主要分为三个部分：“生物化学模型”介绍复杂生物系统的建模问题；“结构生物信息学”从生物信息学角度介绍核酸和蛋白质结构数据库，以及药物小分子和代谢小分子的化学信息学；“分子模拟”部分则重点介绍现代量子化学计算和分子力场计算在生物化学中的应用。作为生物信息学专业的必修课程，《计算生物化学》需要照顾到理工科生物科学、生物工程学生对现代计算机技术基础知识和化学生物学学科发展的需要。和传统的教学模式相比较，这门课程是原来的《分子模拟》和”结构生物信息学”两门课程的重新组合。内容中强化了化学生物学等生物学新兴领域的应用例子，减少了量子力学、计算方法等专业性比较强的内容。其最直接的先行课程是《生物化学》，定性地讲授生物分子的结构和功能。而在高性能科学结构计算模拟方向希望深入学习的学生可以选修后续课程如”量子化学”、”大规模科学计算”、”大数据”等专业课程。和本课程配套的实验课程是《分子模拟》实验，作为后续选修课程的实验课行课时间滞后一学期。

*课程简介（Description）

（所有课程必须填写英文版；内容含概括描述的课程目标）ComputationalBiochemistry,asoneofcomputationalbiologycourses,emphasizesthebasictheoryandcomputationalmethodsformolecularmechanismsofbiochemicalprocesses.Courseisdividedintothreeparts:Biochemicalmodelsdescribesmodelingofcomplexbiologicalsystems;Structuralbioinformaticsdescribesnucleicacidandproteindatabases,aswellascheminformaticsofsmallmoleculedrugsandmetabolites;Molecularmodelingpartfocusesonmodernquantumchemicalcalculationsandforcefieldapplicationsinbiochemistry.Asarequiredcoursesforbioinformaticsstudents,ComputationalBiochemistrytakecareoftheneedsofbiologicalscienceandengineering,moderncomputertechnology,andtheemergingchemicalbiologydiscipline.Comparedtothetraditionalteachingmodel,thiscoursereassembledtheoriginalMolecularModelingandStructuralBioinformaticstwocourses.Contentsofthecoursestrengthenedthecasestudiesofchemicalbiology,reducingquantummechanicsandcomputationalalgorithms.Itsa