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GB/TXXXXX—XXXX
ICS13.080
B10
中华人民共和国国家标准
GB/TXXXXX—XXXX
土壤质量从土壤样品中直接提取DNA的方
法
Soilquality-MethodtodirectlyextractDNAfromsoilsamples
(ISO11063:2012,IDT)
(征求意见稿)
(本稿完成日期:2019.01.30)
XXXX-XX-XX发布XXXX-XX-XX实施
GB/TXXXXX—XXXX
前 言
本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20000.2-2009给出的规则起草。
本标准使用翻译法等同采用ISO11063:2012《土壤质量从土壤样品中直接提取DNA的方法》。
与本标准中规范性引用的国际文件有一致性对应关系的我国文件如下:
——GB/T32725-2016土壤质量实验室测定微生物过程、生物量与多样性用土壤的好氧采集、处
理及贮存指南(ISO10381-6:2009,IDT)。
本标准由全国土壤质量标准化技术委员会(SAC/TC404)归口。
本标准起草单位:中国科学院南京土壤研究所、中国科学院长沙亚热带研究所、江苏省质量和标准
化研究院等。
本标准主要起草人:
GB/TXXXXX—XXXX
引 言
DNA(脱氧核糖核酸)是任何活的生物体不可或缺的组成部分,其编码的酶负责所有生物活动。通
过多种分子方法,对提取自不同基质DNA源的DNA序列的研究,提供了可用于截然区分和鉴定不同生物体
(细菌、古生菌及真核微生物)的分子标识。
到目前为止,大多数旨在建立可用于如土壤的复杂环境的微生物学土壤质量指标的研究,由于许多
[16]
微生物不可培养和传统微生物学方法欠缺灵敏性而造成偏差。很多根自于土壤提取核酸扩增的分子生
物学方法的进展,为基于培养的经典微生物学方法提供了一种恰当的替代方法,为微生物群落组成、丰
富度以及结构提供了独特的视角[15],[18],[26],[27],[36]。基于DNA的方法在土壤生态学中现已广为接受,并作
为确定微生物多样性的基因型(分子遗传)标识。
土壤微生物群落和/或种群的分子学分析结果依赖于两个主要参数:
提取能够代表原有细菌群落组成的DNA;
PCR偏好性,如引物的选择,扩增DNA的浓度,PCR错误,甚至分析所选择的方法[23],[26],[38],[40]。最近,
[20]
大量研究研究了新方法,以改善土壤DNA提取、纯化、扩增和定量。
本标准的目的是为了描述用于从土壤样品中提取DNA的程序。该土壤DNA提取程序的重现性在一项国
际环测试研究(附件A)中进行了评测。该土壤DNA提取方法的重现性成功地通过了定量(q-PCR)和定
性(A-RISA)两种方法的评估。
I
GB/TXXXXX—XXXX
土壤质量从土壤样品中直接提取DNA的方法
1范围
本标准规定了一种用于从土壤样品中提取DNA的方法,用于基于P
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